RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 RAET1EQ8TD07 263 aa8.65□□□□□ -1.02
SMIM20-202ENST00000514384 DEFB118Q96PH6 123 aa8.65□□□□□ -1.02
SMIM20-202ENST00000514384 ASB2Q96Q27 587 aa8.65□□□□□ -1.02
SMIM20-202ENST00000514384 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SMIM20-202ENST00000514384 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.65□□□□□ -1.02
SMIM20-202ENST00000514384 USP16Q9Y5T5 823 aa8.65□□□□□ -1.02
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SMIM20-202ENST00000514384 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.65□□□□□ -1.03
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SMIM20-202ENST00000514384 BRD1O95696 1058 aa8.64□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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SMIM20-202ENST00000514384 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.64□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 SUSD4Q5VX71 490 aa8.64□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 NYXQ9GZU5 481 aa8.64□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.64□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.64□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.64□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 PNMA3Q9UL41 463 aa8.64□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.64□□□□□ -1.03
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SMIM20-202ENST00000514384 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 UBXN2AP68543 259 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 MCTP1Q6DN14 999 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF790Q6PG37 636 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 PODNQ7Z5L7 613 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM47Q96LD4 638 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 RBSNQ9H1K0 784 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 SRRDQ9UH36 339 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 CACNA1GO43497 2377 aa8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 C6orf229H3BNL8 230 aa8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 SASH1O94885 1247 aa8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 HMOX1P09601 288 aa8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 USP17L8P0C7I0 530 aa8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 OSBPP22059 807 aa8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 MCCP23508 829 aa8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 GPT2Q8TD30 523 aa8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 MYPNQ86TC9 1320 aa8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 DYNC1I1O14576 645 aa8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 BBOX1O75936 387 aa8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 KRT37O76014 449 aa8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 PSMC4P43686 418 aa8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 PDE1AP54750 535 aa8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 PRMT2P55345 433 aa8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 TATDN2Q93075 761 aa8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 NLRP3Q96P20 1036 aa8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 POLLQ9UGP5 575 aa8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.6□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 GNAI3P08754 354 aa8.6□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 PRKCZQ05513 592 aa8.6□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 CCL15Q16663 113 aa8.6□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.6□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 ELP3Q9H9T3 547 aa8.6□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 THEGQ9P2T0 379 aa8.6□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 WNT10BO00744 389 aa8.59□□□□□ -1.03
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SMIM20-202ENST00000514384 ELNP15502 786 aa8.59□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 NHLH1Q02575 133 aa8.59□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 GRIN2CQ14957 1233 aa8.59□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 OPTNQ96CV9 577 aa8.59□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 TMX3Q96JJ7 454 aa8.59□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 MXD3Q9BW11 206 aa8.59□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.59□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 CPA4Q9UI42 421 aa8.59□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 SCN9AQ15858 1988 aa8.59□□□□□ -1.03
SMIM20-202ENST00000514384 SMAPO00193 183 aa8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 TLR2O60603 784 aa8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 INHAP05111 366 aa8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 GPSM2P81274 684 aa8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 ATP8B2P98198 1209 aa8.58□□□□□ -1.04
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