RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513134.5

TMA16-208, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, human

TSL 3 BASIC

Gene TMA16, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMA16-208	ENST00000513134	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	USP17L21	D6R901	530 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	CHML	P26374	656 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	INPP5B	P32019	993 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	MAP2K2	P36507	400 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	ECE1	P42892	770 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	EVX2	Q03828	476 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	ALX1	Q15699	326 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	CYP2D6	P10635	497 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	VPS53	Q5VIR6	699 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	SPRYD7	Q5W111	196 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	IL25	Q9H293	177 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	GJA5	P36382	358 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	CAP2	P40123	477 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	JAG1	P78504	1218 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	NOG	Q13253	232 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	SHMT1	P34896	483 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	WNK4	Q96J92	1243 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TMA16-208	ENST00000513134	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	FGA	P02671	866 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	APP	P05067	770 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	PTPRA	P18433	802 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	PPAT	Q06203	517 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	RAD50	Q92878	1312 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	SGSM2	O43147	1006 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	AOC2	O75106	756 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	FGR	P09769	529 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	TM4SF4	P48230	202 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	IRF6	O14896	467 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	TDO2	P48775	406 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	CDK8	P49336	464 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	INHBE	P58166	350 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	PPIL2	Q13356	520 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-208	ENST00000513134	NAPB	Q9H115	298 aa		13.75	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms