RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, human

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2B-208	ENST00000511807	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.76	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.76	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	CYP2C8	P10632	490 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	HOXD10	P28358	340 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	CTGF	P29279	349 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	DSG3	P32926	999 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	ERC2	O15083	957 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	PTPRA	P18433	802 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	MX1	P20591	662 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	OSBP	P22059	807 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.74	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	PDE4A	P27815	886 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	RHBDL3	P58872	404 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	GSTO1	P78417	241 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	HTT	P42858	3142 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	LDHC	P07864	332 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	GRK4	P32298	578 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	PDE1A	P54750	535 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	FCGRT	P55899	365 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	MTFR1	Q15390	333 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21	5e-6	■■■□□ 17
UBE2B-208	ENST00000511807	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.71	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.71	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	BCR	P11274	1271 aa		13.71	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.71	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.71	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
UBE2B-208	ENST00000511807	ATP5J	P18859	108 aa		13.7	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	MCAM	P43121	646 aa		13.7	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.7	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	TBC1D12	O60347	775 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	CCL5	P13501	91 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	UBXN2A	P68543	259 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	SPP2	Q13103	211 aa		13.68	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.68	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.68	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.68	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	RNF208	Q9H0X6	261 aa		13.68	□□□□□ -0.22
UBE2B-208	ENST00000511807	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.68	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms