RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APBB1O00213 710 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLURP2P0DP57 97 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAP2P40123 477 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPAT2Q6NUI2 795 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.43■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DOCK2Q92608 1830 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM196BA6NMK8 535 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRMT2P55345 433 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAGEB6Q8N7X4 407 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FLT1P17948 1338 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM75PA6NK02 468 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAP1Q01518 475 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GADL1Q6ZQY3 521 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NBPF11Q86T75 865 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARMC5Q96C12 935 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM34Q9BYJ4 488 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CPA4Q9UI42 421 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USP17L5A8MUK1 530 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HLA-DOAP06340 250 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HOXD10P28358 340 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF280CQ8ND82 737 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GINM1Q9NU53 330 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PALD1Q9ULE6 856 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADGRA2Q96PE1 1338 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASNSP08243 561 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPP2Q13103 211 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MIGA1Q8NAN2 632 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AS3MTQ9HBK9 375 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAST2Q6P0Q8 1798 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYP2C8P10632 490 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PSMC4P43686 418 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USP5P45974 858 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BCRP11274 1271 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP5JP18859 108 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR18Q9BV38 432 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRCC1Q9C099 1032 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PNMA3Q9UL41 463 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GOLIM4O00461 696 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDE6AP16499 860 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DOCK1Q14185 1865 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SH3D19Q5HYK7 790 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTC6Q86TZ1 520 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM47Q96LD4 638 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BCL11AQ9H165 835 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SRRDQ9UH36 339 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FCGRTP55899 365 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF333Q96JL9 665 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM106CQ9BVX2 250 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EHD4Q9H223 541 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJC18Q9H819 358 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C19orf81C9J6K1 198 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HMGCS2P54868 508 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BOLA2Q9H3K6 86 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PAG1Q9NWQ8 432 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERPINB13Q9UIV8 391 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OSBPP22059 807 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CTGFP29279 349 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BACE1P56817 501 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TREML2Q5T2D2 321 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TATDN1Q6P1N9 297 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HAUS7Q99871 368 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCTPP1Q9H773 170 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMOD4Q9NZQ9 345 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAET1EQ8TD07 263 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PHIPQ8WWQ0 1821 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POTEFA5A3E0 1075 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USP17L10C9JJH3 530 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GDF11O95390 407 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms