RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPAT2Q6NUI2 795 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C17orf99Q6UX52 265 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM75PA6NK02 468 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP3K12Q12852 859 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAGEB6Q8N7X4 407 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAB11FIP3O75154 756 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FLT1P17948 1338 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAP2P40123 477 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MIGA1Q8NAN2 632 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM34Q9BYJ4 488 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHIPQ8WWQ0 1821 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP2C8P10632 490 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PALD1Q9ULE6 856 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOCADQ5VW36 1801 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNRH1P01148 92 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP5P45974 858 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CERS3Q8IU89 383 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADGRA2Q96PE1 1338 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATAD5Q96QE3 1844 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTPRFP10586 1907 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HLA-DOAP06340 250 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSMC4P43686 418 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPP2Q13103 211 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBPF11Q86T75 865 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARMC5Q96C12 935 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP17L5A8MUK1 530 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF280CQ8ND82 737 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBC1D2Q9BYX2 928 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HTTP42858 3142 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIPA1L1O43166 1804 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLIM4O00461 696 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXD10P28358 340 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRMT2P55345 433 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM47Q96LD4 638 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AS3MTQ9HBK9 375 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCRP11274 1271 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTGFP29279 349 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYH1P12882 1939 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POTEFA5A3E0 1075 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASNSP08243 561 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM106CQ9BVX2 250 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAJC18Q9H819 358 aa28.31■■■□□ 2.12
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 HMGCS2P54868 508 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TREML2Q5T2D2 321 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF333Q96JL9 665 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRRDQ9UH36 339 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GDF11O95390 407 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OSBPP22059 807 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FCGRTP55899 365 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH3TC2Q8TF17 1288 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BOLA2Q9H3K6 86 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PNMA3Q9UL41 463 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYCP01106 439 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR18Q9BV38 432 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF532Q9HCE3 1301 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP5JP18859 108 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JAG1P78504 1218 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTC6Q86TZ1 520 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAET1EQ8TD07 263 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GINM1Q9NU53 330 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PAG1Q9NWQ8 432 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
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