RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CPA4Q9UI42 421 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRIM75PA6NK02 468 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PALD1Q9ULE6 856 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CAP2P40123 477 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP5P45974 858 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CERS3Q8IU89 383 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GOLIM4O00461 696 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HLA-DOAP06340 250 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CYP2C8P10632 490 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP17L5A8MUK1 530 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPP2Q13103 211 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.41■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 PDE6AP16499 860 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PSMC4P43686 418 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DOCK1Q14185 1865 aa23.41■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.39■■□□□ 1.34
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 HOXD10P28358 340 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NBPF11Q86T75 865 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARMC5Q96C12 935 aa23.39■■□□□ 1.33
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 GDF11O95390 407 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BCRP11274 1271 aa23.38■■□□□ 1.33
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 TREML2Q5T2D2 321 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TTC6Q86TZ1 520 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTGFP29279 349 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 JAG1P78504 1218 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HAUS7Q99871 368 aa23.37■■□□□ 1.33
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 WDR18Q9BV38 432 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DCTPP1Q9H773 170 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GINM1Q9NU53 330 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PNMA3Q9UL41 463 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OSBPP22059 807 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FCGRTP55899 365 aa23.35■■□□□ 1.33
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SRRDQ9UH36 339 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POTEFA5A3E0 1075 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BACE1P56817 501 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MTMR2Q13614 643 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF333Q96JL9 665 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EHD4Q9H223 541 aa23.34■■□□□ 1.33
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