RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487577.5

TYMP-208, Transcript of thymidine phosphorylase, human

TSL 1 (best)

Gene TYMP, Length 1,751 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TYMP-208	ENST00000487577	ZBTB43	O43298	467 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	SCNN1D	P51172	638 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	DACT2	Q5SW24	774 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	SOGA3	Q5TF21	947 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	TEKT1	Q969V4	418 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	SCN9A	Q15858	1988 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	TRAK2	O60296	914 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	MICU3	Q86XE3	530 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	IQCA1	Q86XH1	822 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	FLT1	P17948	1338 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	TNKS	O95271	1327 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TYMP-208	ENST00000487577		H3BQV1	296 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	IFFO2	Q5TF58	517 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	RXRA	P19793	462 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	NT5C2	P49902	561 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	MYL10	Q9BUA6	226 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	PPFIA3	O75145	1194 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	CDKL5	O76039	1030 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	CRK	P46108	304 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	SEC23A	Q15436	765 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	MRI	Q9BWK5	157 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	USP40	Q9NVE5	1235 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	TSPY2	A6NKD2	308 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	PLCD1	P51178	756 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	MYH1	P12882	1939 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	YDJC	A8MPS7	323 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	PICALM	Q13492	652 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	VPS33B	Q9H267	617 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	FERMT3	Q86UX7	667 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	CDC27	P30260	824 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	RCAN1	P53805	252 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TYMP-208	ENST00000487577	NID2	Q14112	1375 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	28.82	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	FOSB	P53539	338 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	RTN1	Q16799	776 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	TFAP4	Q01664	338 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	TCHH	Q07283	1943 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	PSME4	Q14997	1843 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	NMT2	O60551	498 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	TTC6	Q86TZ1	520 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	TSPY3	P0CV98	308 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	TSPY8	P0CW00	308 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	CDK8	P49336	464 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TYMP-208	ENST00000487577	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2

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