RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484988.2

SGIP1-211, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene SGIP1, Length 440 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-211ENST00000484988 KCT2Q8NC54 265 aa5.15□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 ZNF507Q8TCN5 953 aa5.15□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 NETO1Q8TDF5 533 aa5.15□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 FBXL18Q96ME1 805 aa5.15□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.15□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 ADGRE2Q9UHX3 823 aa5.15□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 SORBS3O60504 671 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 RLBP1P12271 317 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 CAP2P40123 477 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 IRAK1P51617 712 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 OXCT1P55809 520 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 SEPT6Q14141 434 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 MAP3K11Q16584 847 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 CDC37L1Q7L3B6 337 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 ABI1Q8IZP0 508 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 FAM181AQ8N9Y4 354 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 PRDM10Q9NQV6 1147 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 PICK1Q9NRD5 415 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 TACC3Q9Y6A5 838 aa5.14□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 BTBD11A6QL63 1104 aa5.13□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 LRIG2O94898 1065 aa5.13□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 EOMESO95936 686 aa5.13□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 SPRED2Q7Z698 418 aa5.13□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 MISP3Q96FF7 219 aa5.13□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 CRELD1Q96HD1 420 aa5.13□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 FBRSQ9HAH7 460 aa5.13□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 PLAGL2Q9UPG8 496 aa5.13□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 CEACAM5P06731 702 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 NKG7Q16617 165 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 LCE3BQ5TA77 95 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 CBLL1Q75N03 491 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 ARMCX6Q7L4S7 300 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 STK11IPQ8N1F8 1099 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 PHC3Q8NDX5 983 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 FLCNQ8NFG4 579 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 FOXQ1Q9C009 403 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 TNKS2Q9H2K2 1166 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 VAV3Q9UKW4 847 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.12□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 SLITRK5O94991 958 aa5.11□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 LMNB1P20700 586 aa5.11□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 PRKCQQ04759 706 aa5.11□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 BNIP3Q12983 259 aa5.11□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.11□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 HID1Q8IV36 788 aa5.11□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 TP53INP2Q8IXH6 220 aa5.11□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 AGBL5Q8NDL9 886 aa5.11□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.11□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.11□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 TMEM265A0A087WTH1 108 aa5.1□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 GRK4P32298 578 aa5.1□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 LMNB2Q03252 620 aa5.1□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.1□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 MRS2Q9HD23 443 aa5.1□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.1□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 SNX11Q9Y5W9 270 aa5.1□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa5.09□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 FAM221AA4D161 298 aa5.09□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 CD8BP10966 210 aa5.09□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 AOC3Q16853 763 aa5.09□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.09□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.09□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 RIN3Q8TB24 985 aa5.09□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 RHOVQ96L33 236 aa5.09□□□□□ -1.59
SGIP1-211ENST00000484988 CILPO75339 1184 aa5.08□□□□□ -1.6
SGIP1-211ENST00000484988 PF4P02776 101 aa5.08□□□□□ -1.6
SGIP1-211ENST00000484988 FUT4P22083 530 aa5.08□□□□□ -1.6
SGIP1-211ENST00000484988 ITGAEP38570 1179 aa5.08□□□□□ -1.6
SGIP1-211ENST00000484988 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SGIP1-211ENST00000484988 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.08□□□□□ -1.6
SGIP1-211ENST00000484988 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SGIP1-211ENST00000484988 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa5.08□□□□□ -1.6
SGIP1-211ENST00000484988 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.08□□□□□ -1.6
SGIP1-211ENST00000484988 RELL1Q8IUW5 271 aa5.08□□□□□ -1.6
SGIP1-211ENST00000484988 HRASLS5Q96KN8 279 aa5.08□□□□□ -1.6
SGIP1-211ENST00000484988 TMEM74Q96NL1 305 aa5.08□□□□□ -1.6
SGIP1-211ENST00000484988 FMNL2Q96PY5 1086 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms