RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 MYPNQ86TC9 1320 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 MGAMO43451 1857 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 FAM196BA6NMK8 535 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 SRRDQ9UH36 339 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 PNMA3Q9UL41 463 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 OSBPP22059 807 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 TRIM47Q96LD4 638 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 SLC34A2O95436 690 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 ZAP70P43403 619 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 CEP85Q6P2H3 762 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 PANK1Q8TE04 598 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 BCRP11274 1271 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 CAP2P40123 477 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 PPP4CP60510 307 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 SPP2Q13103 211 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 GRK4P32298 578 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 FOCADQ5VW36 1801 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 USP17L5A8MUK1 530 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 HLA-DOAP06340 250 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 CYP7A1P22680 504 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 CTGFP29279 349 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 AACSQ86V21 672 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 CERS3Q8IU89 383 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 GCC1Q96CN9 775 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 UBXN2AP68543 259 aa24.58■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
ACTB-212ENST00000484841 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 USP5P45974 858 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K12Q12852 859 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 FLT1P17948 1338 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 HMMRO75330 724 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 ASNSP08243 561 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 PRKCZQ05513 592 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 HMGCS2P54868 508 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 TREML2Q5T2D2 321 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 PALD1Q9ULE6 856 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.54■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 COA7Q96BR5 231 aa24.54■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 MYH1P12882 1939 aa24.54■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 BCL11AQ9H165 835 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 GINM1Q9NU53 330 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 SIPA1L1O43166 1804 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 APBB1O00213 710 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 MTFR1Q15390 333 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 WDR18Q9BV38 432 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 RNF208Q9H0X6 261 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 GABRQQ9UN88 632 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-212ENST00000484841 ADCY3O60266 1144 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 FLT3LGP49771 235 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.51■■□□□ 1.51
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