RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 PHIPQ8WWQ0 1821 aa19.62■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 VAMP4O75379 141 aa19.62■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 SLURP2P0DP57 97 aa19.62■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 SLC5A1P13866 664 aa19.62■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 FOSL2P15408 326 aa19.62■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa19.62■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 SOCS4Q8WXH5 440 aa19.62■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 IDI2Q9BXS1 227 aa19.62■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 HMGCS2P54868 508 aa19.61■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 MAP3K10Q02779 954 aa19.61■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 SPP2Q13103 211 aa19.61■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 PDE3AQ14432 1141 aa19.61■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 FGFR2P21802 821 aa19.6■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 PICALMQ13492 652 aa19.6■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 KLHDC4Q8TBB5 520 aa19.6■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 E9PSI1 815 aa19.59■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 TNFRSF10AO00220 468 aa19.59■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 LHX8Q68G74 356 aa19.59■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF280CQ8ND82 737 aa19.59■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 LPIN2Q92539 896 aa19.59■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 MORF4L1Q9UBU8 362 aa19.59■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 PLXNB2O15031 1838 aa19.59■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 LOC285556D6RIA3 1793 aa19.58■□□□□ 0.73
SRPRB-204ENST00000484684 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa19.58■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 TTC28Q96AY4 2481 aa19.57■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 SHHQ15465 462 aa19.57■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 TJAP1Q5JTD0 557 aa19.57■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 TBC1D2Q9BYX2 928 aa19.57■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP19.57■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 RFX7Q2KHR2 1363 aa19.57■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 FAM196BA6NMK8 535 aa19.56■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 ANKRD44Q8N8A2 993 aa19.56■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa19.56■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 SALL1Q9NSC2 1324 aa19.55■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 MAST2Q6P0Q8 1798 aa19.55■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 RGS2P41220 211 aa19.55■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 CCL14Q16627 93 aa19.55■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 UTYO14607 1347 aa19.54■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 GAKO14976 1311 aa19.54■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 TBC1D12O60347 775 aa19.54■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 PEX10O60683 326 aa19.54■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 MAPK4P31152 587 aa19.54■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 RTP1P59025 263 aa19.54■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 C9orf50Q5SZB4 431 aa19.54■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 SLF2Q8IX21 1173 aa19.54■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 AS3MTQ9HBK9 375 aa19.54■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 DENND2AQ9ULE3 1009 aa19.54■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.53■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 DNAH12Q6ZR08 3092 aa19.53■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 CDH23Q9H251 3354 aa19.53■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 TMEM265A0A087WTH1 108 aa19.53■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 USP17L5A8MUK1 530 aa19.53■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 PLA2G5P39877 138 aa19.53■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 BTDP43251 543 aa19.53■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 SH3D19Q5HYK7 790 aa19.53■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 FAM122AQ96E09 287 aa19.53■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 APBA2Q99767 749 aa19.53■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa19.53■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 MUC3AQ02505 3323 aa19.53■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 EYA2O00167 538 aa19.52■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 TXNRD2Q9NNW7 524 aa19.52■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 TMOD4Q9NZQ9 345 aa19.52■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 MYH2Q9UKX2 1941 aa19.52■□□□□ 0.72
SRPRB-204ENST00000484684 HERVK_113P62684 666 aa19.51■□□□□ 0.71
SRPRB-204ENST00000484684 MTMR2Q13614 643 aa19.51■□□□□ 0.71
SRPRB-204ENST00000484684 MFSD14CQ5VZR4 134 aa19.51■□□□□ 0.71
SRPRB-204ENST00000484684 GPR142Q7Z601 462 aa19.51■□□□□ 0.71
SRPRB-204ENST00000484684 PLEKHH3Q7Z736 793 aa19.51■□□□□ 0.71
SRPRB-204ENST00000484684 USP6NLQ92738 828 aa19.51■□□□□ 0.71
SRPRB-204ENST00000484684 LTBP2Q14767 1821 aa19.51■□□□□ 0.71
SRPRB-204ENST00000484684 SEMA3EO15041 775 aa19.5■□□□□ 0.71
SRPRB-204ENST00000484684 CNGA1P29973 690 aa19.5■□□□□ 0.71
SRPRB-204ENST00000484684 CAP2P40123 477 aa19.5■□□□□ 0.71
SRPRB-204ENST00000484684 ATP2B3Q16720 1220 aa19.5■□□□□ 0.71
SRPRB-204ENST00000484684 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.5■□□□□ 0.71
SRPRB-204ENST00000484684 PAGR1Q9BTK6 254 aa19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms