RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	APPBP2	Q92624	585 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	KIF16B	Q96L93	1317 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	FAM196B	A6NMK8	535 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	RASA4B	C9J798	803 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	RNF223	E7ERA6	249 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	STXBP3	O00186	592 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	RASA4	O43374	803 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	SGTA	O43765	313 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC159	P0C7I6	412 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ETFB	P38117	255 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	GGCX	P38435	758 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	DAB2	P98082	770 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	COX10	Q12887	443 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	PAK2	Q13177	524 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	BIRC3	Q13489	604 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ARSH	Q5FYA8	562 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	UBR7	Q8N806	425 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	MGARP	Q8TDB4	240 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	TEKT1	Q969V4	418 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	C1orf74	Q96LT6	269 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	CDH19	Q9H159	772 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	SEPT3	Q9UH03	358 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	FAM25E	A8MYX2	175 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	NEFH	P12036	1026 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	KIF5B	P33176	963 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ECE1	P42892	770 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	WNT7B	P56706	349 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	MYBPC3	Q14896	1274 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	OCLN	Q16625	522 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	VPS52	Q8N1B4	723 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	DNAJC7	Q99615	494 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM260	Q9NX78	707 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	STAP2	Q9UGK3	403 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-214	ENST00000472398	ERBB4	Q15303	1308 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TREH	O43280	583 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CAPN3	P20807	821 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CNGA1	P29973	690 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	GALNS	P34059	522 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	HTR3A	P46098	478 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PFKP	Q01813	784 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	APBA1	Q02410	837 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ERFE	Q4G0M1	354 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	DACT2	Q5SW24	774 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	DAAM2	Q86T65	1068 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF511	Q8NB15	262 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SCLT1	Q96NL6	688 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TSPY26P	Q9H489	355 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CYLD	Q9NQC7	956 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		3.77	□□□□□ -1.81

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