RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471643.1

RALGPS1-211, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 681 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-211ENST00000471643 SPP2Q13103 211 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 LPIN2Q92539 896 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 MORF4L1Q9UBU8 362 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 GAKO14976 1311 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 SALL1Q9NSC2 1324 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF697Q5TEC3 545 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 MYH13Q9UKX3 1938 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 HMGCS2P54868 508 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 CCDC184Q52MB2 194 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 SEMA6BQ9H3T3 888 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 FAM196BA6NMK8 535 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 TBC1D12O60347 775 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 SLC5A1P13866 664 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 ATG9AQ7Z3C6 839 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF280CQ8ND82 737 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 USP6NLQ92738 828 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 TXNRD2Q9NNW7 524 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-211ENST00000471643 EYA2O00167 538 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 PICALMQ13492 652 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 CCL14Q16627 93 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 SH3D19Q5HYK7 790 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 COL9A1P20849 921 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 MYLIPQ8WY64 445 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 NUDT12Q9BQG2 462 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 MAST2Q6P0Q8 1798 aa18.12■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 PHKA1P46020 1223 aa18.12■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 RHBDL3P58872 404 aa18.12■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 SHHQ15465 462 aa18.12■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 POTEEQ6S8J3 1075 aa18.12■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 Q3C1V9 767 aa18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 C9orf50Q5SZB4 431 aa18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 WDR63Q8IWG1 891 aa18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 DENND2AQ9ULE3 1009 aa18.11■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 XIRP2A4UGR9 3374 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 MYH2Q9UKX2 1941 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 ZBTB22O15209 634 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 CAP2P40123 477 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 BTDP43251 543 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 MORN1Q5T089 497 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF384Q8TF68 577 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 USP44Q9H0E7 712 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 PORCNQ9H237 461 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 RBPJLQ9UBG7 517 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa18.1■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 LTBP2Q14767 1821 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 USP17L5A8MUK1 530 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 SEMA3EO15041 775 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 TBC1D2Q9BYX2 928 aa18.09■□□□□ 0.49
RALGPS1-211ENST00000471643 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 HERVK_113P62684 666 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 ATP2B3Q16720 1220 aa18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 FRMPD3Q5JV73 1810 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 JAG1P78504 1218 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 GPR142Q7Z601 462 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 FLRT1Q9NZU1 646 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 BDP1A6H8Y1 2624 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.07■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 ADORA1P30542 326 aa18.06■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 MAPK4P31152 587 aa18.06■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 RGS2P41220 211 aa18.06■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 BACE1P56817 501 aa18.06■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 MTMR2Q13614 643 aa18.06■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 RASGRF1Q13972 1273 aa18.06■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 CCDC102BQ68D86 513 aa18.06■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 WDR18Q9BV38 432 aa18.06■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 ATAD5Q96QE3 1844 aa18.06■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 FOSL2P15408 326 aa18.05■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 RTP1P59025 263 aa18.05■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 ERVK-9P63128 1117 aa18.05■□□□□ 0.48
RALGPS1-211ENST00000471643 ERVK-24P63145 666 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms