RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 DISC1Q9NRI5 854 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 HTR3BO95264 441 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 GLB1P16278 677 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 EIF6P56537 245 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 MBTPS1Q14703 1052 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 PPM1JQ5JR12 505 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 CSADQ9Y600 493 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-205ENST00000462042 GRIN3BO60391 1043 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 PGRP06401 933 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 PLCG1P19174 1290 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 ASPAP45381 313 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 CLCQ05315 142 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 PPT2Q9UMR5 302 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 ALX3O95076 343 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 DRD2P14416 443 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 NOS3P29474 1203 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 GRK4P32298 578 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 USP11P51784 963 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 RBL2Q08999 1139 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 HID1Q8IV36 788 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 IGSF3O75054 1194 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 PREPP48147 710 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 GIPRP48546 466 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 TTLL4Q14679 1199 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 TNNI3KQ59H18 835 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 SHDQ96IW2 340 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 GMIPQ9P107 970 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 CAP2P40123 477 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC6A19Q695T7 634 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 NBPF4Q96M43 638 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 TM9SF2Q99805 663 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 PRKAG3Q9UGI9 489 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 NTF4P34130 210 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP7Q14244 749 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.039e-34■□□□□ 10.3
RABGGTB-205ENST00000462042 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 ISL2Q96A47 359 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 DCAF5Q96JK2 942 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM87BQ96K49 555 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 MYRFLQ96LU7 910 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-205ENST00000462042 KRBA1A5PL33 1030 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 NEFMP07197 916 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC12A7Q9Y666 1083 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 ETFBP38117 255 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 CASP7P55210 303 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNMA1Q12791 1236 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM13CQ8NE31 585 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-205ENST00000462042 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.57□□□□□ -1.04
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