RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 ZIC5Q96T25 663 aa22.12■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.12■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.12■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.12■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 FAM196BA6NMK8 535 aa22.11■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.11■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 TICAM2Q86XR7 235 aa22.11■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 OSBP2Q969R2 916 aa22.11■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.11■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 DOCK1Q14185 1865 aa22.11■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 PCNTO95613 3336 aa22.11■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.1■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 PRKAB2O43741 272 aa22.1■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 SREBF2Q12772 1141 aa22.1■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 ERO1BQ86YB8 467 aa22.1■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.1■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 OTUD5Q96G74 571 aa22.1■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 WBP1LQ9NX94 342 aa22.1■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.09■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 GPAA1O43292 621 aa22.09■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 SLURP2P0DP57 97 aa22.09■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 GNAT2P19087 354 aa22.09■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.09■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.09■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 PICK1Q9NRD5 415 aa22.09■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.08■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 LAMB1P07942 1786 aa22.08■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 M0R2C6 588 aa22.08■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 EHD4Q9H223 541 aa22.08■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.08■■□□□ 1.13
DDR1-241ENST00000460944 GJA5P36382 358 aa22.07■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 PPATQ06203 517 aa22.07■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 TTC22Q5TAA0 569 aa22.07■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.07■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.07■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 CA12O43570 354 aa22.06■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 INHBEP58166 350 aa22.06■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 PPIL2Q13356 520 aa22.06■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.06■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 MYH8P13535 1937 aa22.06■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 APPP05067 770 aa22.05■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 GTF2A2P52657 109 aa22.05■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 DNAJC18Q9H819 358 aa22.05■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 HIP1O00291 1037 aa22.04■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 CAP2P40123 477 aa22.04■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 TM4SF4P48230 202 aa22.04■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 PLCD1P51178 756 aa22.04■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.04■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.04■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.04■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.03■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 IRF6O14896 467 aa22.03■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 PTPRAP18433 802 aa22.03■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 SDSP20132 328 aa22.03■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 TDO2P48775 406 aa22.03■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 SNAPC2Q13487 334 aa22.03■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.03■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 USP17L12C9JPN9 530 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 USP17L21D6R901 530 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 FOXN1O15353 648 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 CYP2D6P10635 497 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 FAM227BQ96M60 508 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 GINM1Q9NU53 330 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-241ENST00000460944 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.01■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 A0A0D9SFI3 127 aa22.01■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 GDF11O95390 407 aa22.01■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 ASNSP08243 561 aa22.01■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 CETPP11597 493 aa22.01■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 CCL15Q16663 113 aa22.01■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 C12orf60Q5U649 245 aa22.01■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 CTR9Q6PD62 1173 aa22.01■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.01■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.01■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 SWAP70Q9UH65 585 aa22.01■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.01■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 ALDH1A1P00352 501 aa22■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 GABPAQ06546 454 aa22■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
DDR1-241ENST00000460944 TATDN1Q6P1N9 297 aa22■■□□□ 1.11
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