RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 RXRAP19793 462 aa24.64■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 MRIQ9BWK5 157 aa24.64■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.64■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 SBF1O95248 1867 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 MYL10Q9BUA6 226 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 FZD9O00144 591 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 SCRN1Q12765 414 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 CERS3Q8IU89 383 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 OGFOD1Q8N543 542 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 FGRP09769 529 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 LY9Q9HBG7 655 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 SPDYE6P0CI01 402 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 ESR2Q92731 530 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 DLGAP5Q15398 846 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM196BA6NMK8 535 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 GTF3C6Q969F1 213 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 JAK2O60674 1132 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 PDE4BQ07343 736 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 TNIP1Q15025 636 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 CDK8P49336 464 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-204ENST00000452765 TNKSO95271 1327 aa24.58■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 ORC4O43929 436 aa24.58■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 LMNB1P20700 586 aa24.58■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.58■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 FBXL16Q8N461 479 aa24.58■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 IL27Q8NEV9 243 aa24.58■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.58■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 TFAP4Q01664 338 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM87BQ96K49 555 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 TSPY2A6NKD2 308 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 PFKFB2O60825 505 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 CTDNEP1O95476 244 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 RASA1P20936 1047 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 GJB2P29033 226 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 MICU3Q86XE3 530 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 MICALL2Q8IY33 904 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX11Q96FC9 970 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 IDI2Q9BXS1 227 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 VEZTQ9HBM0 779 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 WNT10BO00744 389 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 EVCP57679 992 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 WTAPQ15007 396 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 SEC23AQ15436 765 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 APOA5Q6Q788 366 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF181Q9P0P0 153 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-204ENST00000452765 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms