RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449039.5

LRRC23-210, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC23, Length 729 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-210ENST00000449039 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
LRRC23-210ENST00000449039 C17orf99Q6UX52 265 aa24.96■■□□□ 1.59
LRRC23-210ENST00000449039 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.96■■□□□ 1.59
LRRC23-210ENST00000449039 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.96■■□□□ 1.59
LRRC23-210ENST00000449039 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
LRRC23-210ENST00000449039 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.96■■□□□ 1.59
LRRC23-210ENST00000449039 FLT1P17948 1338 aa24.95■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 CAP1Q01518 475 aa24.95■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.95■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 BCL11AQ9H165 835 aa24.95■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.95■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 TRIM75PA6NK02 468 aa24.94■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 GNRH1P01148 92 aa24.94■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 CAP2P40123 477 aa24.94■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.94■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.94■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.94■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 CPA4Q9UI42 421 aa24.94■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.93■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.93■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 FOCADQ5VW36 1801 aa24.92■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.92■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.92■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 HLA-DOAP06340 250 aa24.91■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 USP5P45974 858 aa24.91■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.91■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 PALD1Q9ULE6 856 aa24.91■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.9■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 USP17L5A8MUK1 530 aa24.9■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 NBPF11Q86T75 865 aa24.9■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.9■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 ARMC5Q96C12 935 aa24.9■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.9■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 PTPRFP10586 1907 aa24.9■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 CYP2C8P10632 490 aa24.89■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 PRMT2P55345 433 aa24.89■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 SPP2Q13103 211 aa24.89■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.89■■□□□ 1.58
LRRC23-210ENST00000449039 HTTP42858 3142 aa24.89■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.89■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 GOLIM4O00461 696 aa24.88■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 ASNSP08243 561 aa24.88■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 HOXD10P28358 340 aa24.88■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 PSMC4P43686 418 aa24.88■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.88■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.88■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.88■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 GINM1Q9NU53 330 aa24.88■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.88■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.87■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 MYH1P12882 1939 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 BCRP11274 1271 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 PDE6AP16499 860 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 PNMA3Q9UL41 463 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 SIPA1L1O43166 1804 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 ATP5JP18859 108 aa24.85■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 TTC6Q86TZ1 520 aa24.85■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 TRIM47Q96LD4 638 aa24.85■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 WDR18Q9BV38 432 aa24.85■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.85■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 DNAJC18Q9H819 358 aa24.85■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 HMGCS2P54868 508 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 FCGRTP55899 365 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 CTGFP29279 349 aa24.83■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 TREML2Q5T2D2 321 aa24.83■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 ZNF333Q96JL9 665 aa24.83■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 SRRDQ9UH36 339 aa24.83■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.83■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
LRRC23-210ENST00000449039 CENPFP49454 3210 aa24.82■■□□□ 1.56
LRRC23-210ENST00000449039 GDF11O95390 407 aa24.82■■□□□ 1.56
LRRC23-210ENST00000449039 OSBPP22059 807 aa24.82■■□□□ 1.56
LRRC23-210ENST00000449039 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.82■■□□□ 1.56
LRRC23-210ENST00000449039 HAUS7Q99871 368 aa24.82■■□□□ 1.56
LRRC23-210ENST00000449039 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
LRRC23-210ENST00000449039 EHD4Q9H223 541 aa24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms