RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SDR42E1Q8WUS8 393 aa32.71■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 APPBP2Q92624 585 aa32.71■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATAD5Q96QE3 1844 aa32.7■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa32.7■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ERO1BQ86YB8 467 aa32.7■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EVI5LQ96CN4 794 aa32.7■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OTUD5Q96G74 571 aa32.7■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRKAB2O43741 272 aa32.69■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HLA-DOAP06340 250 aa32.69■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OSBP2Q969R2 916 aa32.69■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PDE4AP27815 886 aa32.68■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TM4SF4P48230 202 aa32.68■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SREBF2Q12772 1141 aa32.68■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SCYL3Q8IZE3 742 aa32.67■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DNAJC18Q9H819 358 aa32.66■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CA12O43570 354 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPATQ06203 517 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPIL2Q13356 520 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TTC6Q86TZ1 520 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MCM9Q9NXL9 1143 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 M0R2C6 588 aa32.64■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PHIPQ8WWQ0 1821 aa32.64■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIM34Q9BYJ4 488 aa32.64■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RNF186Q9NXI6 227 aa32.64■■■□□ 2.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 INHBEP58166 350 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MS4A4AQ96JQ5 239 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EHD4Q9H223 541 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PICK1Q9NRD5 415 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IRF6O14896 467 aa32.62■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GPAA1O43292 621 aa32.62■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NEFLP07196 543 aa32.62■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLCD1P51178 756 aa32.62■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SAGE1Q9NXZ1 904 aa32.62■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TSKSQ9UJT2 592 aa32.62■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CAP2P40123 477 aa32.61■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GTF2A2P52657 109 aa32.61■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RILPL2Q969X0 211 aa32.61■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SERPINB13Q9UIV8 391 aa32.61■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRPA1O75762 1119 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PTPRAP18433 802 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EVX2Q03828 476 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IFNL1Q8IU54 200 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP32.58■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CYP2D6P10635 497 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LBX1P52954 281 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCL15Q16663 113 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TICAM2Q86XR7 235 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DDRGK1Q96HY6 314 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZHX2Q9Y6X8 837 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GSG1L2A8MUP6 293 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SNAPC2Q13487 334 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BRI3BPQ8WY22 251 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PTPN18Q99952 460 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KCNH4Q9UQ05 1017 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PTPRFP10586 1907 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MYH8P13535 1937 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GNAT2P19087 354 aa32.56■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GABPAQ06546 454 aa32.56■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TATDN1Q6P1N9 297 aa32.56■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 USP17L12C9JPN9 530 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 USP17L21D6R901 530 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CETPP11597 493 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GDF11O95390 407 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ALDH1A1P00352 501 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 JAG1P78504 1218 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TTC22Q5TAA0 569 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C12orf60Q5U649 245 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GIMAP6Q6P9H5 292 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AMOTL1Q8IY63 956 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HELLSQ9NRZ9 838 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SHMT1P34896 483 aa32.53■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CTR9Q6PD62 1173 aa32.53■■■□□ 2.8
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms