RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.28	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.28	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.28	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.28	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	GJA5	P36382	358 aa		13.27	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	LBX1	P52954	281 aa		13.27	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.27	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.27	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.27	□□□□□ -0.28
UBXN7-205	ENST00000429160	PTPRF	P10586	1907 aa		13.27	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	MYH8	P13535	1937 aa		13.27	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	GNAT2	P19087	354 aa		13.27	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.27	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.27	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.27	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.26	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.26	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.26	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	NUCB1	Q02818	461 aa		13.26	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	APPBP2	Q92624	585 aa		13.26	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.26	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.26	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.25	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	INPP5B	P32019	993 aa		13.25	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	CCL15	Q16663	113 aa		13.25	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.25	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.25	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	PTPRA	P18433	802 aa		13.25	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	CAP2	P40123	477 aa		13.25	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.25	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.25	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.25	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.24	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.24	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	TRPA1	O75762	1119 aa		13.24	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	ASNS	P08243	561 aa		13.24	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.24	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.24	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.24	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.23	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	FKTN	O75072	461 aa		13.23	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	PDE1A	P54750	535 aa		13.23	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.23	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.23	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.23	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	MBD4	O95243	580 aa		13.23	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.23	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.23	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.22	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	GPR25	O00155	361 aa		13.22	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.22	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.22	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.22	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.22	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	C19orf81	C9J6K1	198 aa		13.22	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	IRF6	O14896	467 aa		13.22	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.22	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.21	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	HIP1	O00291	1037 aa		13.21	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.21	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.21	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.21	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.21	□□□□□ -0.29
UBXN7-205	ENST00000429160	GNRH1	P01148	92 aa		13.21	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.21	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.21	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	IGHD	P01880	384 aa		13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	GABPA	Q06546	454 aa		13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	PTPN18	Q99952	460 aa		13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.2	□□□□□ -0.3
UBXN7-205	ENST00000429160	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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