RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP5JP18859 108 aa19.68■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SP3Q02447 781 aa19.68■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARHGEF6Q15052 776 aa19.68■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DCTPP1Q9H773 170 aa19.68■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PAG1Q9NWQ8 432 aa19.68■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNH4Q9UQ05 1017 aa19.68■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa19.67■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM17Q9Y577 477 aa19.67■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDE6AP16499 860 aa19.66■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GADL1Q6ZQY3 521 aa19.66■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD23Q86SG2 305 aa19.66■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CRBNQ96SW2 442 aa19.66■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PALD1Q9ULE6 856 aa19.66■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DOCK1Q14185 1865 aa19.66■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDHXO00330 501 aa19.65■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLURP2P0DP57 97 aa19.65■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIF22Q14807 665 aa19.65■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa19.65■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CD99L2Q8TCZ2 262 aa19.65■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HAUS7Q99871 368 aa19.65■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBC1D2Q9BYX2 928 aa19.65■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AS3MTQ9HBK9 375 aa19.65■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ECHDC1Q9NTX5 307 aa19.65■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF532Q9HCE3 1301 aa19.65■□□□□ 0.74
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM75PA6NK02 468 aa19.64■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TLR2O60603 784 aa19.64■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CAP2P40123 477 aa19.64■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa19.64■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TTC6Q86TZ1 520 aa19.64■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa19.64■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EFCC1Q9HA90 598 aa19.63■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa19.63■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FOCADQ5VW36 1801 aa19.62■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ASNSP08243 561 aa19.62■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OTOP1Q7RTM1 612 aa19.62■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HPS5Q9UPZ3 1129 aa19.62■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP17L5A8MUK1 530 aa19.61■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF280CQ8ND82 737 aa19.61■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDRGK1Q96HY6 314 aa19.61■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa19.6■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADD2P35612 726 aa19.6■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPP2Q13103 211 aa19.6■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AMOTL1Q8IY63 956 aa19.6■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GINM1Q9NU53 330 aa19.6■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SERPINB13Q9UIV8 391 aa19.6■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PNMA3Q9UL41 463 aa19.6■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ERC2O15083 957 aa19.59■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP19.59■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AAMPQ13685 434 aa19.59■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EHD4Q9H223 541 aa19.59■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MCM9Q9NXL9 1143 aa19.59■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CPA4Q9UI42 421 aa19.59■□□□□ 0.73
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa19.58■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MBD4O95243 580 aa19.58■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GDF11O95390 407 aa19.58■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UBE3CQ15386 1083 aa19.58■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LCORLQ8N3X6 602 aa19.58■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARMT1Q9H993 441 aa19.58■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMOD4Q9NZQ9 345 aa19.58■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa19.58■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa19.58■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYH1P12882 1939 aa19.58■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATAD5Q96QE3 1844 aa19.58■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TTC41PQ6P2S7 1318 aa19.57■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MOGSQ13724 837 aa19.57■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPAT2Q6NUI2 795 aa19.57■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SDR42E1Q8WUS8 393 aa19.57■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DNAJC18Q9H819 358 aa19.57■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa19.57■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTPN22Q9Y2R2 807 aa19.57■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CYP2C8P10632 490 aa19.56■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HMGCS2P54868 508 aa19.56■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TSHZ3Q63HK5 1081 aa19.56■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C17orf99Q6UX52 265 aa19.56■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GCC1Q96CN9 775 aa19.56■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CABP5Q9NP86 173 aa19.56■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NAV1Q8NEY1 1877 aa19.56■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SIPA1L1O43166 1804 aa19.55■□□□□ 0.72
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GNRH1P01148 92 aa19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.9 ms