RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 TLR6Q9Y2C9 796 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 LIG3P49916 1009 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 IRAK1P51617 712 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 DAB2P98082 770 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 FGD1P98174 961 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 RING1Q06587 406 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 NKG7Q16617 165 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 CYP27C1Q4G0S4 372 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 MCTP1Q6DN14 999 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 VSIG10LQ86VR7 867 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 TP53INP2Q8IXH6 220 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ANKRD24Q8TF21 1146 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 FRMD6Q96NE9 622 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 MRS2Q9HD23 443 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 LMNB1P20700 586 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 SPRED2Q7Z698 418 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 XAGE3Q8WTP9 111 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 VTI1BQ9UEU0 232 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 FANCGO15287 622 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 PRNPP04156 253 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 GRK4P32298 578 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 OXCT1P55809 520 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 AGMOQ6ZNB7 445 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 HDXQ7Z353 690 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 TMC4Q7Z404 712 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 NETO1Q8TDF5 533 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 PLAGL2Q9UPG8 496 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 E9PSI1 815 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 SORBS3O60504 671 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 EOMESO95936 686 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 ITGAEP38570 1179 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 FAM214BQ7L5A3 538 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 PHC3Q8NDX5 983 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 RIN3Q8TB24 985 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 MIPEPQ99797 713 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 SLC5A6Q9Y289 635 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 PRR33A8MZF0 331 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 GFRA2O00451 464 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 SLITRK5O94991 958 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 CEACAM5P06731 702 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 CD8BP10966 210 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 RPS26P62854 115 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 FAM160A1Q05DH4 1040 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 PLCL1Q15111 1095 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 AOC3Q16853 763 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF507Q8TCN5 953 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 CRELD1Q96HD1 420 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 FBXL18Q96ME1 805 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 PRDM7Q9NQW5 492 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 CORINQ9Y5Q5 1042 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 USP31Q70CQ4 1352 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 UNCXA6NJT0 531 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 MINDY4BA8MYZ0 360 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 LRIG2O94898 1065 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 PF4P02776 101 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 PGRP06401 933 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 ST13P50502 369 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 SCARA3Q6AZY7 606 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 HID1Q8IV36 788 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 SPACA3Q8IXA5 215 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 FOXQ1Q9C009 403 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 COPRSQ9NQ92 184 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 TJP2Q9UDY2 1190 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 CBX7O95931 251 aa4.03□□□□□ -1.76
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