RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423941.5

HDAC6-205, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-205ENST00000423941 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.2■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.2■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 GPAA1O43292 621 aa22.2■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 AOC2O75106 756 aa22.2■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.2■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 DNAJC18Q9H819 358 aa22.2■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.2■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 SDSP20132 328 aa22.19■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 TTC6Q86TZ1 520 aa22.19■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 RILPL2Q969X0 211 aa22.19■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.19■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.19■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 GNAT2P19087 354 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 GJA5P36382 358 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 PLCD1P51178 756 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 GABPAQ06546 454 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 WNK4Q96J92 1243 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 CSADQ9Y600 493 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 DOCK1Q14185 1865 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 HLA-DOAP06340 250 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 ERO1BQ86YB8 467 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 FAM227BQ96M60 508 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.17■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 FAM196BA6NMK8 535 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 FOXP2O15409 715 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 SBK1Q52WX2 424 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 C12orf60Q5U649 245 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 ELP3Q9H9T3 547 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 WBP1LQ9NX94 342 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 A0A0D9SFI3 127 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 CAP2P40123 477 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 TM4SF4P48230 202 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 CTR9Q6PD62 1173 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 OPTNQ96CV9 577 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HDAC6-205ENST00000423941 USP17L12C9JPN9 530 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 USP17L21D6R901 530 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
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HDAC6-205ENST00000423941 EVX2Q03828 476 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 PPATQ06203 517 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 GRM1Q13255 1194 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 SKAP1Q86WV1 359 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 HIP1O00291 1037 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 CYP2D6P10635 497 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 PTPRAP18433 802 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 SHMT1P34896 483 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 INHBEP58166 350 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 JAG1P78504 1218 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 PPIL2Q13356 520 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 ALX1Q15699 326 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 GINM1Q9NU53 330 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 SMIM22K7EJ46 135 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 PTPRFP10586 1907 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 IRF6O14896 467 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 OTUD5Q96G74 571 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 CHMLP26374 656 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 VPS53Q5VIR6 699 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 SWAP70Q9UH65 585 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 MYH8P13535 1937 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 CXCL11O14625 94 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC6-205ENST00000423941 ASNSP08243 561 aa22.08■■□□□ 1.13
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