RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPP2Q13103 211 aa20.66■□□□□ 0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.66■□□□□ 0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GAKO14976 1311 aa20.66■□□□□ 0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.66■□□□□ 0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EYA2O00167 538 aa20.65■□□□□ 0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HMGCS2P54868 508 aa20.64■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDE3AQ14432 1141 aa20.64■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PICALMQ13492 652 aa20.63■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.63■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.62■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB22O15209 634 aa20.62■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLURP2P0DP57 97 aa20.62■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LHX8Q68G74 356 aa20.62■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.62■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.62■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP17L5A8MUK1 530 aa20.61■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAPK4P31152 587 aa20.61■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP2B3Q16720 1220 aa20.61■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.61■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGS2P41220 211 aa20.6■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BTDP43251 543 aa20.6■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO3Q9UK99 471 aa20.6■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAP2P40123 477 aa20.59■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.59■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.59■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLXNB2O15031 1838 aa20.59■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.58■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP6NLQ92738 828 aa20.58■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.58■□□□□ 0.89
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.57■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.57■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM196BA6NMK8 535 aa20.57■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHKA1P46020 1223 aa20.57■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APBA2Q99767 749 aa20.57■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCF2Q9UG63 623 aa20.57■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.56■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MSCO60682 206 aa20.56■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CIAO1O76071 339 aa20.56■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HERVK_113P62684 666 aa20.56■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR18Q9BV38 432 aa20.56■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP44Q9H0E7 712 aa20.56■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BACE1P56817 501 aa20.55■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHBDL3P58872 404 aa20.55■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MORN1Q5T089 497 aa20.55■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR142Q7Z601 462 aa20.55■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.55■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.55■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C19orf81C9J6K1 198 aa20.54■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FOSL2P15408 326 aa20.54■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL9A1P20849 921 aa20.54■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERVK-9P63128 1117 aa20.54■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERVK-24P63145 666 aa20.54■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTMR2Q13614 643 aa20.54■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCL14Q16627 93 aa20.54■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.54■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC102BQ68D86 513 aa20.54■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYLIPQ8WY64 445 aa20.54■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EYSQ5T1H1 3165 aa20.54■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHHQ15465 462 aa20.53■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LPAR1Q92633 364 aa20.53■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIL1Q9H173 461 aa20.53■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.53■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.53■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPRCP08575 1304 aa20.53■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNM1LO00429 736 aa20.52■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LDHCP07864 332 aa20.52■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASNSP08243 561 aa20.52■□□□□ 0.88
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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