RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 ABI1Q8IZP0 508 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 TOP6BLQ8N6T0 577 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 AGBL5Q8NDL9 886 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 NETO1Q8TDF5 533 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 DUSP23Q9BVJ7 150 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 SLC5A6Q9Y289 635 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 LEFTY1O75610 366 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 KCT2Q8NC54 265 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 MISP3Q96FF7 219 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 MKNK2Q9HBH9 465 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 RING1Q06587 406 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 HDXQ7Z353 690 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-207ENST00000418674 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 IGSF5Q9NSI5 407 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 PARP2Q9UGN5 583 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-207ENST00000418674 NTF4P34130 210 aa4.79□□□□□ -1.64
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PTPRC-207ENST00000418674 LRFN4Q6PJG9 635 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 GAL3ST3Q96A11 431 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 PLPPR2Q96GM1 343 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 RNF19AQ9NV58 838 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 ITIH2P19823 946 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 OXCT1P55809 520 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 DAB2P98082 770 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 PRKCQQ04759 706 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 INPP5AQ14642 412 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 UBE3DQ7Z6J8 389 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 HRASLS5Q96KN8 279 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 VAV3Q9UKW4 847 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-207ENST00000418674 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 LRIG2O94898 1065 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRC-207ENST00000418674 TXKP42681 527 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 LIG3P49916 1009 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 BNIP3Q12983 259 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 PLCL1Q15111 1095 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRC-207ENST00000418674 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 AGMOQ6ZNB7 445 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 CBLL1Q75N03 491 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 RNF114Q9Y508 228 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 U3KQE9 123 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 GNAT3A8MTJ3 354 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 ITGAEP38570 1179 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 ST13P50502 369 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 SEPT6Q14141 434 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 AOC3Q16853 763 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 MEI1Q5TIA1 1274 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 TMC4Q7Z404 712 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 SPRED2Q7Z698 418 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-207ENST00000418674 FOXQ1Q9C009 403 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 SNX11Q9Y5W9 270 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 EOMESO95936 686 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 RECKO95980 971 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 CD8BP10966 210 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 FUT4P22083 530 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 GRK4P32298 578 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 CDK8P49336 464 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 LCE1DQ5T752 114 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-207ENST00000418674 FAM214BQ7L5A3 538 aa4.75□□□□□ -1.65
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