RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 USP49Q70CQ1 688 aa21.49■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.49■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.49■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 TEX33O43247 280 aa21.49■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 METTL24Q5JXM2 366 aa21.49■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.49■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 MLKLQ8NB16 471 aa21.49■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 GOLGA1Q92805 767 aa21.49■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 ZBTB9Q96C00 473 aa21.49■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 TMEM87BQ96K49 555 aa21.49■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 LZTFL1Q9NQ48 299 aa21.49■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 NR1I3Q14994 352 aa21.48■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.48■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.48■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 ABCC12Q96J65 1359 aa21.48■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 PTPREP23469 700 aa21.48■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 TCIRG1Q13488 830 aa21.48■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 FBXO3Q9UK99 471 aa21.48■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.48■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 MST1RQ04912 1400 aa21.48■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 H3BQF6 201 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 MMP1P03956 469 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 ATP2B1P20020 1258 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 TXLNAP40222 546 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 NR5A1Q13285 461 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.47■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.46■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 CSF1RP07333 972 aa21.46■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 PDE6AP16499 860 aa21.46■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.46■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 ATRNO75882 1429 aa21.46■■□□□ 1.03
NEFHP1-201ENST00000412845 A0A1B0GTH6 734 aa21.45■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC175P0C221 793 aa21.45■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.45■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ADGRG1Q9Y653 693 aa21.45■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 STK36Q9NRP7 1315 aa21.45■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CHD4Q14839 1912 aa21.45■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CHMP4BP1P59074 171 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 RBL2Q08999 1139 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 UBE3CQ15386 1083 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 VGLL3A8MV65 326 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 IFNAR1P17181 557 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 PHKA1P46020 1223 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 PLCD1P51178 756 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 STX17P56962 302 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 OXER1Q8TDS5 423 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 GREM2Q9H772 168 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 DACH1Q9UI36 760 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 MYH8P13535 1937 aa21.44■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC151A5D8V7 595 aa21.43■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CASP1P29466 404 aa21.43■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 LIFRP42702 1097 aa21.43■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.43■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CSRNP2Q9H175 543 aa21.43■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa21.43■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ITGA6P23229 1130 aa21.43■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 PANX2Q96RD6 677 aa21.43■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ADAM21Q9UKJ8 722 aa21.43■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 A0A087X0B3 334 aa21.42■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 MAP2K7O14733 419 aa21.42■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.42■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 AIDAQ96BJ3 306 aa21.42■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.42■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.42■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.42■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 SPATA20Q8TB22 786 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms