RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 FBF1Q8TES7 1133 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 ACSBG1Q96GR2 724 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 OSBPL7Q9BZF2 842 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 WWC3Q9ULE0 1092 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC5A6Q9Y289 635 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-55P-201ENST00000411092 ENC1O14682 589 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 FBXO24O75426 580 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 LEFTY1O75610 366 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 BMP6P22004 513 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 GSTT1P30711 240 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 BNIP3Q12983 259 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM181AQ8N9Y4 354 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 RNF214Q8ND24 703 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 AGBL5Q8NDL9 886 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ISL2Q96A47 359 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ASB16Q96NS5 453 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 DNMBPQ6XZF7 1577 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 WDR97A6NE52 1622 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 FMN1Q68DA7 1419 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PAGE1O75459 146 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ERVK-24P63145 666 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPM1JQ5JR12 505 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPRED2Q7Z698 418 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 STK11IPQ8N1F8 1099 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 NETO1Q8TDF5 533 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANP32EQ9BTT0 268 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 DUSP23Q9BVJ7 150 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 CSADQ9Y600 493 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 U3KQE9 123 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 CADPSQ9ULU8 1353 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 HFM1A2PYH4 1435 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 AKNAQ7Z591 1439 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 DCDC2CA8MYV0 355 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ATP2B2Q01814 1243 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 KCNA1Q09470 495 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLCL1Q15111 1095 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ERICH6BQ5W0A0 696 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 TOP6BLQ8N6T0 577 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 CEP44Q9C0F1 390 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPM1HQ9ULR3 514 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 SAMM50Q9Y512 469 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PHLDB1Q86UU1 1377 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 UACAQ9BZF9 1416 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 SAMD9Q5K651 1589 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 HECW1Q76N89 1606 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 GCC2Q8IWJ2 1684 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 GIPC1O14908 333 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRIM37O94972 964 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 CD8BP10966 210 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 LCE1DQ5T752 114 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 C12orf40Q86WS4 652 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 MISP3Q96FF7 219 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PICK1Q9NRD5 415 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCDHA4Q9UN74 947 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPG7Q9UQ90 795 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 FGD6Q6ZV73 1430 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCDC18Q5T9S5 1454 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTPN23Q9H3S7 1636 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANP32CO43423 234 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 CEACAM5P06731 702 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 CELA3AP09093 270 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 USP17L7P0C7H9 530 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ITGB5P18084 799 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 NTF4P34130 210 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 CD96P40200 585 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 OXCT1P55809 520 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRKCQQ04759 706 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRRC14Q15048 493 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 RASIP1Q5U651 963 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 OGFOD2Q6N063 350 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 UBE3DQ7Z6J8 389 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 ASIC4Q96FT7 647 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 C12orf49Q9H741 205 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 MKNK2Q9HBH9 465 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 VAV3Q9UKW4 847 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLAGL2Q9UPG8 496 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 P4HBP07237 508 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-55P-201ENST00000411092 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms