RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 ANTXR2P58335 489 aa24.85■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 AMPD2Q01433 879 aa24.85■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.85■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 KRT40Q6A162 431 aa24.85■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.85■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 MYD88Q99836 296 aa24.85■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 ALG1Q9BT22 464 aa24.85■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.84■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 TEX33O43247 280 aa24.84■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 MFAP3LO75121 409 aa24.84■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.83■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.83■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 AIFM3Q96NN9 605 aa24.83■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.83■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.83■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 PLCD1P51178 756 aa24.83■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 ABTB2Q8N961 1025 aa24.83■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC51Q96ER9 411 aa24.83■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 CPDO75976 1380 aa24.83■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 PRR29P0C7W0 189 aa24.82■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 PSEN1P49768 467 aa24.82■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.82■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 ZMYM6O95789 1325 aa24.82■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 MYO6Q9UM54 1294 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 EXOC5O00471 708 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 FOXP2O15409 715 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 MCM3P25205 808 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 E2F4Q16254 413 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF827Q17R98 1081 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 MAP9Q49MG5 647 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.81■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 ERLIN2O94905 339 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGAP25P42331 645 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 USP14P54578 494 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 CNGA4Q8IV77 575 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 NCOA7Q8NI08 942 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 GPR108Q9NPR9 543 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 C5P01031 1676 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 HAND2P61296 217 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 ACRBPQ8NEB7 543 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 KAT2BQ92831 832 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 OSBP2Q969R2 916 aa24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.79■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 CPLX3Q8WVH0 158 aa24.79■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.79■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 NFAT5O94916 1531 aa24.79■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 CDKL5O76039 1030 aa24.79■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 GPATCH11Q8N954 259 aa24.79■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 SPATA20Q8TB22 786 aa24.79■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 ABL1P00519 1130 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 COG1Q8WTW3 980 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 ITIH6Q6UXX5 1313 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 CASP14P31944 242 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.78■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.77■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 SPATA1Q5VX52 437 aa24.77■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CLDN5-201ENST00000403084 GYPCP04921 128 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 STIM1Q13586 685 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 COPS6Q7L5N1 327 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 FBXO41Q8TF61 875 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 MYH8P13535 1937 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 FGAP02671 866 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 SPECC1Q5M775 1068 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 CDKAL1Q5VV42 579 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.76■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 SEMA3EO15041 775 aa24.75■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 MYL6BP14649 208 aa24.75■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 ERVK-24P63145 666 aa24.75■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 TRDNQ13061 729 aa24.75■■□□□ 1.55
CLDN5-201ENST00000403084 KANK3Q6NY19 840 aa24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms