RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 SLFNL1Q499Z3 407 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 OSBP2Q969R2 916 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ELP3Q9H9T3 547 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 MCM9Q9NXL9 1143 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 TAOK2Q9UL54 1235 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 PDE4AP27815 886 aa18.47■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa18.47■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ERO1BQ86YB8 467 aa18.47■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ABHD8Q96I13 439 aa18.47■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 WNK4Q96J92 1243 aa18.47■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 PICK1Q9NRD5 415 aa18.47■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 PHF20L1A8MW92 1017 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 HIP1O00291 1037 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 GPAA1O43292 621 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 CHGBP05060 677 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 INPP5BP32019 993 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 INHBEP58166 350 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 SREBF2Q12772 1141 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 EHD4Q9H223 541 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 HELLSQ9NRZ9 838 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 SERPINB13Q9UIV8 391 aa18.46■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 SPDYE5A6NIY4 337 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 CA12O43570 354 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 PRKAB2O43741 272 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 TTC22Q5TAA0 569 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 SCYL3Q8IZE3 742 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 OPTNQ96CV9 577 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 NACAP1Q9BZK3 213 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa18.45■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 APPP05067 770 aa18.44■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 PPATQ06203 517 aa18.44■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 OTUD5Q96G74 571 aa18.44■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa18.44■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 GINM1Q9NU53 330 aa18.44■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.44■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 FOCADQ5VW36 1801 aa18.44■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 SDSP20132 328 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 GTF2A2P52657 109 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 MYH1P12882 1939 aa18.43■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM196BA6NMK8 535 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 M0R2C6 588 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 CAP2P40123 477 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 TM4SF4P48230 202 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 PPIL2Q13356 520 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa18.42■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC85CA6NKD9 419 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 GSG1L2A8MUP6 293 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 USP17L12C9JPN9 530 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 USP17L21D6R901 530 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 ASNSP08243 561 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 TDO2P48775 406 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 PLCD1P51178 756 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 SNAPC2Q13487 334 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D2Q9BYX2 928 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 SWAP70Q9UH65 585 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 ALDH1A1P00352 501 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 CETPP11597 493 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRAP18433 802 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 SBK1Q52WX2 424 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 C12orf60Q5U649 245 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 CXCL11O14625 94 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 IRF6O14896 467 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 SLURP2P0DP57 97 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 GJA5P36382 358 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 TATDN1Q6P1N9 297 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 CTR9Q6PD62 1173 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM227BQ96M60 508 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 NAPBQ9H115 298 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 CABP5Q9NP86 173 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 ZHX2Q9Y6X8 837 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 OTOFQ9HC10 1997 aa18.39■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 USP17L5A8MUK1 530 aa18.38■□□□□ 0.53
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