RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 TCP10Q12799 353 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 ESR2Q92731 530 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 VEZTQ9HBM0 779 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 SMIM22K7EJ46 135 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 AK2P54819 239 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 INCENPQ9NQS7 918 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-202ENST00000375150 PRC1O43663 620 aa22.32■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 KDM4AO75164 1064 aa22.32■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 EVX2Q03828 476 aa22.32■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.32■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 EGFRP00533 1210 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 TNFAIP1Q13829 316 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 Q6ZUG5 572 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 FAM83AQ86UY5 434 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 EHD4Q9H223 541 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 PRDM1O75626 825 aa22.3■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 TNNI2P48788 182 aa22.3■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 FAM151AQ8WW52 585 aa22.3■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.3■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 MYH8P13535 1937 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 EPS15P42566 896 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 ANTXR2P58335 489 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 CHST3Q7LGC8 479 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 FBXL16Q8N461 479 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 TMEM87BQ96K49 555 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 MTA3Q9BTC8 594 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 SWAP70Q9UH65 585 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 GLTPD2A6NH11 291 aa22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 CNTNAP1P78357 1384 aa22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 CDK8P49336 464 aa22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 SIPA1L1O43166 1804 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 GABPAQ06546 454 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 IQCA1Q86XH1 822 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 BRF1Q92994 677 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-202ENST00000375150 TSPY2A6NKD2 308 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 TMX3Q96JJ7 454 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 CSRNP1Q96S65 589 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 HACL1Q9UJ83 578 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 ERICH2A1L162 156 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 SCN4AP35499 1836 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 RASA1P20936 1047 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 SLC4A3P48751 1232 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.24■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.24■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 TSPY3P0CV98 308 aa22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 TSPY8P0CW00 308 aa22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 TFAP4Q01664 338 aa22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 RASA3Q14644 834 aa22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-202ENST00000375150 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.23■■□□□ 1.15
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