RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 INPP5BP32019 993 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 CHMP4BP1P59074 171 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC42Q96M95 316 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 PLCD1P51178 756 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 KRT83P78385 493 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC174Q6PII3 467 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 SPATA24Q86W54 205 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC114Q96M63 670 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 PFKFB2O60825 505 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 FGAP02671 866 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 SPECC1Q5M775 1068 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 CNPY4Q8N129 248 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 GOLGA1Q92805 767 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 GCKP35557 465 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 TTC38Q5R3I4 469 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 CEP83Q9Y592 693 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 KIF5AQ12840 1032 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-204ENST00000368210 CTAGE9A4FU28 777 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 KRT86O43790 486 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF75DP51815 510 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CNGA4Q8IV77 575 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 GPR108Q9NPR9 543 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 TACC1O75410 805 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 MLKLQ8NB16 471 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 OPA1O60313 960 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 GREM2Q9H772 168 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 KRT13P13646 458 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 GOPCQ9HD26 462 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ANKRD62A6NC57 917 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 PDE8BO95263 885 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 FANCCQ00597 558 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 PPARAQ07869 468 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 HDXQ7Z353 690 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 TBC1D5Q92609 795 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 USP28Q96RU2 1077 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 SV2BQ7L1I2 683 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 USP17L12C9JPN9 530 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 USP17L21D6R901 530 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CIAO1O76071 339 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ICE2Q659A1 982 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ADALQ6DHV7 355 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 BICD1Q96G01 975 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 GLI2P10070 1586 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 NLRP12P59046 1061 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ARID5AQ03989 594 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 FSD2A1L4K1 749 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 BCAMP50895 628 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 TFAP4Q01664 338 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 PPP2R5AQ15172 486 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 USP37Q86T82 979 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 NEK11Q8NG66 645 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 GYG1P46976 350 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 PPP1R2P41236 205 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-204ENST00000368210 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms