RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 MTMR6Q9Y217 621 aa23.55■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 ERICH2A1L162 156 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 SMIM22K7EJ46 135 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 NT5C2P49902 561 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 MRIQ9BWK5 157 aa23.54■■□□□ 1.36
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SUMO3-201ENST00000332859 SCNN1DP51172 638 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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SUMO3-201ENST00000332859 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 FLT1P17948 1338 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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SUMO3-201ENST00000332859 WTAPQ15007 396 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 USP48Q86UV5 1035 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 TMTC2Q8N394 836 aa23.52■■□□□ 1.36
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SUMO3-201ENST00000332859 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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SUMO3-201ENST00000332859 CCDC69A6NI79 296 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 YDJCA8MPS7 323 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 JAK2O60674 1132 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 FOCADQ5VW36 1801 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-201ENST00000332859 PSME4Q14997 1843 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 PRDM1O75626 825 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 APOA5Q6Q788 366 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 KIF3AQ9Y496 699 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 DTNBO60941 627 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 CTDNEP1O95476 244 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 EVX2Q03828 476 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 IQCA1Q86XH1 822 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 USP40Q9NVE5 1235 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.5■■□□□ 1.35
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SUMO3-201ENST00000332859 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 SENP2Q9HC62 589 aa23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 TNKSO95271 1327 aa23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 NIM1KQ8IY84 436 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 DDX11Q96FC9 970 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 CPLX1O14810 134 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 SEC23AQ15436 765 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 NID2Q14112 1375 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 COL4A5P29400 1685 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 PLCD1P51178 756 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 RCAN1P53805 252 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 UBE2HP62256 183 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 MICU3Q86XE3 530 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.46■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 MYH1P12882 1939 aa23.46■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 TSPY2A6NKD2 308 aa23.46■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 PICALMQ13492 652 aa23.46■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SUMO3-201ENST00000332859 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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