RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA5Q8NB90 893 aa25.02■■□□□ 1.6
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PTPRM-201ENST00000332175 FAM204AQ9H8W3 233 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRM-201ENST00000332175 ANAPC4Q9UJX5 808 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRM-201ENST00000332175 LONRF3Q496Y0 759 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRM-201ENST00000332175 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRM-201ENST00000332175 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.01■■□□□ 1.59
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PTPRM-201ENST00000332175 GEN1Q17RS7 908 aa25■■□□□ 1.59
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PTPRM-201ENST00000332175 ZMYND15Q9H091 742 aa24.96■■□□□ 1.59
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PTPRM-201ENST00000332175 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.93■■□□□ 1.58
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PTPRM-201ENST00000332175 VIMP08670 466 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 FAM76AQ8TAV0 307 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 EVCP57679 992 aa24.93■■□□□ 1.58
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PTPRM-201ENST00000332175 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRM-201ENST00000332175 NIM1KQ8IY84 436 aa24.93■■□□□ 1.58
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