RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 SARM1Q6SZW1 724 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 LY9Q9HBG7 655 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 DESI2Q9BSY9 194 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 PRR29P0C7W0 189 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF174Q15697 407 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 TEX35Q5T0J7 233 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 PDE4BQ07343 736 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 UBE3CQ15386 1083 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 SMARCE1Q969G3 411 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM87BQ96K49 555 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 CARD6Q9BX69 1037 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 CDC25BP30305 580 aa22.72■■□□□ 1.23
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SPNS2-201ENST00000329078 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 PLIN2Q99541 437 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 CDC25AP30304 524 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 GNG11P61952 73 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.7■■□□□ 1.22
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SPNS2-201ENST00000329078 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 ST5P78524 1137 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 CHRNDQ07001 517 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 EPSTI1Q96J88 318 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 KRT23Q9C075 422 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 NMT2O60551 498 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 EVX2Q03828 476 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 TNKSO95271 1327 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 NCAPHQ15003 741 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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SPNS2-201ENST00000329078 POSTNQ15063 836 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
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SPNS2-201ENST00000329078 CSRNP2Q9H175 543 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 CBFA2T2O43439 604 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 PPARAQ07869 468 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 CUTAO60888 179 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 CAPN2P17655 700 aa22.67■■□□□ 1.22
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SPNS2-201ENST00000329078 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
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SPNS2-201ENST00000329078 PTPAQ15257 358 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD65E5RJM6 399 aa22.66■■□□□ 1.22
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SPNS2-201ENST00000329078 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
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SPNS2-201ENST00000329078 NTRK3Q16288 839 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 FAM182BQ5T319 152 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 CPDO75976 1380 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 LMAN1P49257 510 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 ESR2Q92731 530 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 FBXO3Q9UK99 471 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS2-201ENST00000329078 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.65■■□□□ 1.22
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