RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324394.7

ZNF404-201, Transcript of zinc finger protein 404, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF404, Length 1,844 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404-201ENST00000324394 PIF1Q9H611 641 aa6.35□□□□□ -1.39
ZNF404-201ENST00000324394 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.35□□□□□ -1.39
ZNF404-201ENST00000324394 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.35□□□□□ -1.39
ZNF404-201ENST00000324394 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.34□□□□□ -1.39
ZNF404-201ENST00000324394 HTR3BO95264 441 aa6.34□□□□□ -1.39
ZNF404-201ENST00000324394 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
ZNF404-201ENST00000324394 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.34□□□□□ -1.39
ZNF404-201ENST00000324394 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.34□□□□□ -1.39
ZNF404-201ENST00000324394 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
ZNF404-201ENST00000324394 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 RAC1P63000 192 aa6.34□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.34□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 RAD18Q9NS91 495 aa6.34□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.34□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 SLFN14P0C7P3 912 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 IMPDH2P12268 514 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 RING1Q06587 406 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 SERINC3Q13530 473 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 RAB33AQ14088 237 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 PPM1JQ5JR12 505 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 NBPF4Q96M43 638 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 DNAJA2O60884 412 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ACAD11Q709F0 780 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 TMPRSS2O15393 492 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 PLCG1P19174 1290 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 GRK4P32298 578 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ID3Q02535 119 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.32□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 DRD2P14416 443 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 GATA4P43694 442 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ERVK-24P63145 666 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 GRIK4Q16099 956 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 TNNI3KQ59H18 835 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.31□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 MEGF11A6BM72 1044 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 PGRP06401 933 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ELNP15502 786 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 NTF4P34130 210 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 PPP2R5EQ16537 467 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 RNF208Q9H0X6 261 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 DISC1Q9NRI5 854 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.3□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 PDE4BQ07343 736 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ST7Q9NRC1 585 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 PICK1Q9NRD5 415 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 KLHL3Q9UH77 587 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ADH5P11766 374 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 CASP7P55210 303 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ATG4CQ96DT6 458 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms