RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 HLA-DOAP06340 250 aa26.17■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.17■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.17■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 MCM5P33992 734 aa26.16■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 BECN1Q14457 450 aa26.16■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 FAM151AQ8WW52 585 aa26.16■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 PRDM1O75626 825 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 CHST3Q7LGC8 479 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 HSCBQ8IWL3 235 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 SCN4AP35499 1836 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 ORC4O43929 436 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 KDM4AO75164 1064 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 FAM83AQ86UY5 434 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 ESR2Q92731 530 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 HACL1Q9UJ83 578 aa26.15■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 SIPA1L1O43166 1804 aa26.14■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 TNNI2P48788 182 aa26.14■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 MCM2P49736 904 aa26.14■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 AK2P54819 239 aa26.14■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.14■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.14■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 PI4KBQ9UBF8 816 aa26.14■■□□□ 1.78
CTU2-201ENST00000312060 CNTNAP1P78357 1384 aa26.14■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 ATRNL1Q5VV63 1379 aa26.14■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 PRC1O43663 620 aa26.13■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.13■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.13■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.13■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 SERPINB13Q9UIV8 391 aa26.13■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 CDK8P49336 464 aa26.12■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 ANTXR2P58335 489 aa26.12■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 FGD1P98174 961 aa26.12■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 GABPAQ06546 454 aa26.12■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 TNFAIP1Q13829 316 aa26.12■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 Q6ZUG5 572 aa26.12■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 WDR19Q8NEZ3 1342 aa26.12■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 ANKRD1Q15327 319 aa26.12■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 EHD4Q9H223 541 aa26.12■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.11■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 NT5C2P49902 561 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 RASA3Q14644 834 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 CSRNP1Q96S65 589 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 SWAP70Q9UH65 585 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 WDR90Q96KV7 1748 aa26.09■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 EPHX2P34913 555 aa26.09■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.09■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 TSPY2A6NKD2 308 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 FBXL16Q8N461 479 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 TMEM87BQ96K49 555 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 GGA3Q9NZ52 723 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa26.08■■□□□ 1.77
CTU2-201ENST00000312060 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 RASA1P20936 1047 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 IQCA1Q86XH1 822 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 BRF1Q92994 677 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 SLC4A3P48751 1232 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 TFAP4Q01664 338 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-201ENST00000312060 MTA3Q9BTC8 594 aa26.06■■□□□ 1.76
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