RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TTC9B-201ENST00000311308 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.64■■□□□ 1.54
TTC9B-201ENST00000311308 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TTC9B-201ENST00000311308 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 FAM196BA6NMK8 535 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 CYP2C8P10632 490 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 CYP7A1P22680 504 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 MAP3K12Q12852 859 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.63■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 HTTP42858 3142 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 POTEFA5A3E0 1075 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 CAP2P40123 477 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 FCGRTP55899 365 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 SRRDQ9UH36 339 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 PNMA3Q9UL41 463 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 COG6Q9Y2V7 657 aa24.62■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 FLT1P17948 1338 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 HLA-DOAP06340 250 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 BCRP11274 1271 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 RAET1EQ8TD07 263 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.61■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 USP17L5A8MUK1 530 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 TRIM47Q96LD4 638 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 DOCK1Q14185 1865 aa24.6■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 OSBPP22059 807 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 SPP2Q13103 211 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.59■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 ASNSP08243 561 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 GINM1Q9NU53 330 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC9B-201ENST00000311308 MYPNQ86TC9 1320 aa24.58■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 RAB11FIP3O75154 756 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 USP5P45974 858 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 PALD1Q9ULE6 856 aa24.57■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 APBB1O00213 710 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 CTGFP29279 349 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 CENPFP49454 3210 aa24.56■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 HMGCS2P54868 508 aa24.55■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.55■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 GRK4P32298 578 aa24.54■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 TREML2Q5T2D2 321 aa24.54■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 WDR18Q9BV38 432 aa24.54■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.54■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.54■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 UBXN2AP68543 259 aa24.53■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 PRKCZQ05513 592 aa24.53■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 PDE3AQ14432 1141 aa24.53■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.53■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 BCL11AQ9H165 835 aa24.53■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 BACE1P56817 501 aa24.52■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.52■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 TTC6Q86TZ1 520 aa24.52■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.52■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.52■■□□□ 1.52
TTC9B-201ENST00000311308 C19orf81C9J6K1 198 aa24.51■■□□□ 1.51
TTC9B-201ENST00000311308 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.51■■□□□ 1.51
TTC9B-201ENST00000311308 COA7Q96BR5 231 aa24.51■■□□□ 1.51
TTC9B-201ENST00000311308 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TTC9B-201ENST00000311308 DNAJC18Q9H819 358 aa24.51■■□□□ 1.51
TTC9B-201ENST00000311308 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.5■■□□□ 1.51
TTC9B-201ENST00000311308 USP17L10C9JJH3 530 aa24.5■■□□□ 1.51
TTC9B-201ENST00000311308 GDF11O95390 407 aa24.5■■□□□ 1.51
TTC9B-201ENST00000311308 MTMR2Q13614 643 aa24.5■■□□□ 1.51
TTC9B-201ENST00000311308 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.5■■□□□ 1.51
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