RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 USP17L21D6R901 530 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 CYP2D6P10635 497 aa26.72■■□□□ 1.87
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HOXD4-201ENST00000306324 IL25Q9H293 177 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 MAP3K11Q16584 847 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 CTR9Q6PD62 1173 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 KLRG1Q96E93 195 aa26.71■■□□□ 1.87
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HOXD4-201ENST00000306324 NAPBQ9H115 298 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXD4-201ENST00000306324 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
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HOXD4-201ENST00000306324 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.7■■□□□ 1.87
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HOXD4-201ENST00000306324 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
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HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D12O60347 775 aa26.69■■□□□ 1.86
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HOXD4-201ENST00000306324 MAP3K10Q02779 954 aa26.68■■□□□ 1.86
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HOXD4-201ENST00000306324 SBK1Q52WX2 424 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD4-201ENST00000306324 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
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HOXD4-201ENST00000306324 SMIM22K7EJ46 135 aa26.66■■□□□ 1.86
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
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HOXD4-201ENST00000306324 ELP3Q9H9T3 547 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD4-201ENST00000306324 LAMA4Q16363 1823 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD4-201ENST00000306324 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.62■■□□□ 1.85
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HOXD4-201ENST00000306324 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.61■■□□□ 1.85
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HOXD4-201ENST00000306324 GDF11O95390 407 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD4-201ENST00000306324 CAP2P40123 477 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD4-201ENST00000306324 PTH1RQ03431 593 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD4-201ENST00000306324 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD4-201ENST00000306324 SCYL3Q8IZE3 742 aa26.6■■□□□ 1.85
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HOXD4-201ENST00000306324 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.59■■□□□ 1.85
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HOXD4-201ENST00000306324 HAND2P61296 217 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD4-201ENST00000306324 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXD4-201ENST00000306324 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD4-201ENST00000306324 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD4-201ENST00000306324 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD4-201ENST00000306324 PCNTO95613 3336 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD4-201ENST00000306324 SLC10A3P09131 477 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD4-201ENST00000306324 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD4-201ENST00000306324 OPTNQ96CV9 577 aa26.57■■□□□ 1.84
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