RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303731.8

TRAPPC1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC1, Length 811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-201ENST00000303731 CPA4Q9UI42 421 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC1-201ENST00000303731 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC1-201ENST00000303731 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC1-201ENST00000303731 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZNF333Q96JL9 665 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC1-201ENST00000303731 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC1-201ENST00000303731 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC1-201ENST00000303731 CAP2P40123 477 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC1-201ENST00000303731 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC1-201ENST00000303731 AACSQ86V21 672 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC1-201ENST00000303731 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC1-201ENST00000303731 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.33■□□□□ 0.85
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TRAPPC1-201ENST00000303731 MAP3K12Q12852 859 aa20.32■□□□□ 0.84
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TRAPPC1-201ENST00000303731 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.32■□□□□ 0.84
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TRAPPC1-201ENST00000303731 GINM1Q9NU53 330 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 PNMA3Q9UL41 463 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.32■□□□□ 0.84
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TRAPPC1-201ENST00000303731 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 FAM196BA6NMK8 535 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 USP17L5A8MUK1 530 aa20.3■□□□□ 0.84
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TRAPPC1-201ENST00000303731 TRIM47Q96LD4 638 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 COG6Q9Y2V7 657 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 MGAMO43451 1857 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 SIPA1L1O43166 1804 aa20.3■□□□□ 0.84
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TRAPPC1-201ENST00000303731 SPP2Q13103 211 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 RAET1EQ8TD07 263 aa20.28■□□□□ 0.84
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TRAPPC1-201ENST00000303731 MYH1P12882 1939 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 PDE3AQ14432 1141 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 WDR18Q9BV38 432 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC1-201ENST00000303731 CTGFP29279 349 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 USP5P45974 858 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 PALD1Q9ULE6 856 aa20.26■□□□□ 0.83
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TRAPPC1-201ENST00000303731 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.25■□□□□ 0.83
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TRAPPC1-201ENST00000303731 TREML2Q5T2D2 321 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.24■□□□□ 0.83
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TRAPPC1-201ENST00000303731 EHD4Q9H223 541 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 DNAJC18Q9H819 358 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 C19orf81C9J6K1 198 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 BACE1P56817 501 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 UBXN2AP68543 259 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 TTC6Q86TZ1 520 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC1-201ENST00000303731 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.23■□□□□ 0.83
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