RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 KLHL34Q8N239 644 aa24.87■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 ANKRD7Q92527 254 aa24.87■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 FEZ1Q99689 392 aa24.87■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa24.87■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.87■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 USP25Q9UHP3 1055 aa24.87■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.87■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 PRDM1O75626 825 aa24.87■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 KRT40Q6A162 431 aa24.87■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 CTR9Q6PD62 1173 aa24.87■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.86■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 TNKSO95271 1327 aa24.86■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.86■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 TYRO3Q06418 890 aa24.86■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 RTN1Q16799 776 aa24.86■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.86■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 USP17L12C9JPN9 530 aa24.86■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 USP17L21D6R901 530 aa24.86■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.86■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 EVX2Q03828 476 aa24.85■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 STK38Q15208 465 aa24.85■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 TPM3P06753 285 aa24.85■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 GPSM2P81274 684 aa24.85■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.85■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.85■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 MTA3Q9BTC8 594 aa24.85■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.85■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 NID2Q14112 1375 aa24.84■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 MYH2Q9UKX2 1941 aa24.84■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.84■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 CRY2Q49AN0 593 aa24.84■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 TMTC2Q8N394 836 aa24.84■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.84■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 LINC00301Q8NCQ3 95 aa24.84■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.84■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 DDR1Q08345 913 aa24.83■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 TRIM29Q14134 588 aa24.83■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 FSIP1Q8NA03 581 aa24.83■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 IFNAR1P17181 557 aa24.83■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.83■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.83■■□□□ 1.57
MESP1-201ENST00000300057 STK36Q9NRP7 1315 aa24.83■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 SEC23AQ15436 765 aa24.82■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 TXNRD1Q16881 649 aa24.82■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 MPNDQ8N594 471 aa24.82■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 CTIFO43310 598 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 UFL1O94874 794 aa24.82■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 GUCY1A2P33402 732 aa24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 PROM2Q8N271 834 aa24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 YEATS4O95619 227 aa24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 CYP2D6P10635 497 aa24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 PLCB2Q00722 1185 aa24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 FANCBQ8NB91 859 aa24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 RGS22Q8NE09 1264 aa24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 KIAA1524Q8TCG1 905 aa24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.81■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 SPTLC2O15270 562 aa24.8■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.8■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 ANO1Q5XXA6 986 aa24.8■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.8■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.8■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 OGFRQ9NZT2 677 aa24.8■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.8■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 LAMB1P07942 1786 aa24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 KINO60870 393 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 GRIK5Q16478 980 aa24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 ADALQ6DHV7 355 aa24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 WASF1Q92558 559 aa24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 IQCA1Q86XH1 822 aa24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 ENGASEQ8NFI3 743 aa24.79■■□□□ 1.56
MESP1-201ENST00000300057 A0A1B0GVL5 298 aa24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms