RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 AK9Q5TCS8 1911 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 PGBD1Q96JS3 809 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 TAOK3Q9H2K8 898 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 MROH5Q6ZUA9 1318 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRG-201ENST00000295874 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa13.9□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 POTEB2H3BUK9 544 aa13.9□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 PAFAH1B1P43034 410 aa13.9□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 NDUFA8P51970 172 aa13.9□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 PHKBQ93100 1093 aa13.9□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 EYA3Q99504 573 aa13.9□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM94Q12767 1356 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 AFMP43652 599 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 UBE3CQ15386 1083 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 MLKLQ8NB16 471 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 OSBP2Q969R2 916 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 RMND1Q9NWS8 449 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 M0R2C6 588 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 GSTO1P78417 241 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 CETN1Q12798 172 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 SEPT6Q14141 434 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 HOMER2Q9NSB8 354 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 MON2Q7Z3U7 1717 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 KAT6BQ8WYB5 2073 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 ERICH4A6NGS2 130 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 CTSWP56202 376 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 PPP2R5BQ15173 497 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 LINC00301Q8NCQ3 95 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 DHX58Q96C10 678 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 TSPY2A6NKD2 308 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 N4BP3O15049 544 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 ADORA1P30542 326 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 SARM1Q6SZW1 724 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 TPTE2Q6XPS3 522 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 KRT2P35908 639 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 UBE4AQ14139 1066 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 SPA17Q15506 151 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 MIGA1Q8NAN2 632 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 ARMT1Q9H993 441 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 CLIC4Q9Y696 253 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 PDE6AP16499 860 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 ADD1P35611 737 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 PARP10Q53GL7 1025 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 SPATA5Q8NB90 893 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP13.88□□□□□ -0.192e-6■□□□□ 11.3
PTPRG-201ENST00000295874 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 WDR17Q8IZU2 1322 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 SLC39A14Q15043 492 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 C3P01024 1663 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 TNNI2P48788 182 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 AKNAD1Q5T1N1 836 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 NOD1Q9Y239 953 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 SAMM50Q9Y512 469 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP13.87□□□□□ -0.194e-6■■□□□ 13.2
PTPRG-201ENST00000295874 TAF12Q16514 161 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 KAT14Q9H8E8 782 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 ATP6V1AP38606 617 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 ZWINTO95229 277 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 UBA7P41226 1012 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 TIGD1Q96MW7 591 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 CARD10Q9BWT7 1032 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 WWC3Q9ULE0 1092 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 ARHGAP6O43182 974 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 RRAGBQ5VZM2 374 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 PDIA6Q15084 440 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 MYL10Q9BUA6 226 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 PALLDQ8WX93 1383 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 CALML3P27482 149 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 NYXQ9GZU5 481 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 VEZTQ9HBM0 779 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 KIF4AO95239 1232 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 PDE8BO95263 885 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 HSPA2P54652 639 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRG-201ENST00000295874 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.5 ms