RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 VGLL4Q14135 290 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 RASA3Q14644 834 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP100Q494V2 611 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 GBP4Q96PP9 640 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 MYD88Q99836 296 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 MINPP1Q9UNW1 487 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 JAG2Q9Y219 1238 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 UNCXA6NJT0 531 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 MYO1BO43795 1136 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 TLR2O60603 784 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 GNAI2P04899 355 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 GJB1P08034 283 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 OSBPP22059 807 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2A2P52657 109 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNC4Q03721 635 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 RABEP1Q15276 862 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC22Q5TAA0 569 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 RAET1EQ8TD07 263 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM47Q96LD4 638 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 GREM2Q9H772 168 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 CPA4Q9UI42 421 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 MYPNQ86TC9 1320 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 DOCK3Q8IZD9 2030 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 AK9Q5TCS8 1911 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 BTBD19C9JJ37 291 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 REC8O95072 547 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 MCM4P33991 863 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMC4P43686 418 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 CTSWP56202 376 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP85Q6P2H3 762 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 SRRDQ9UH36 339 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 SNAP23O00161 211 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 GNRH1P01148 92 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 SYN1P17600 705 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 MCCP23508 829 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP14P50281 582 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 PRMT2P55345 433 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKCZQ05513 592 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM39BQ9GZU3 492 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 HYPKQ9NX55 129 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 CSADQ9Y600 493 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXB7P09629 217 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNJ4P48050 445 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 TEPSINQ96N21 525 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 GDF15Q99988 308 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 CD209Q9NNX6 404 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC28Q96AY4 2481 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPRFP10586 1907 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 IRF6O14896 467 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 SGPL1O95470 568 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 TFRCP02786 760 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 CETPP11597 493 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms