RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 CSADQ9Y600 493 aa26.88■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 LAMB1P07942 1786 aa26.87■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 EVX2Q03828 476 aa26.87■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 SPDYE5A6NIY4 337 aa26.86■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 M0R2C6 588 aa26.86■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 TM4SF4P48230 202 aa26.86■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.86■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 FOXN1O15353 648 aa26.85■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 PLCD1P51178 756 aa26.85■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.85■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 ERO1BQ86YB8 467 aa26.85■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 AIDAQ96BJ3 306 aa26.85■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 MS4A4AQ96JQ5 239 aa26.85■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.84■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.83■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 OTUD5Q96G74 571 aa26.83■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.83■■□□□ 1.89
SYF2-201ENST00000236273 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 SMIM22K7EJ46 135 aa26.82■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 GPAA1O43292 621 aa26.82■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 JAG1P78504 1218 aa26.82■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 SCYL3Q8IZE3 742 aa26.82■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 EHD4Q9H223 541 aa26.82■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.82■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 GSG1L2A8MUP6 293 aa26.81■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 IRF6O14896 467 aa26.81■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 CYP2D6P10635 497 aa26.81■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 PPATQ06203 517 aa26.81■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 GABPAQ06546 454 aa26.81■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 TICAM2Q86XR7 235 aa26.81■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DOAP06340 250 aa26.8■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 PTPRAP18433 802 aa26.8■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 CAP2P40123 477 aa26.8■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 TTC6Q86TZ1 520 aa26.8■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 PTPN18Q99952 460 aa26.8■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 RNF186Q9NXI6 227 aa26.8■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.79■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.79■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 PPIL2Q13356 520 aa26.79■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.79■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 RILPL2Q969X0 211 aa26.79■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 SERPINB13Q9UIV8 391 aa26.79■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 DOCK1Q14185 1865 aa26.79■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 INHBEP58166 350 aa26.78■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 TTC22Q5TAA0 569 aa26.78■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.78■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.77■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 USP17L12C9JPN9 530 aa26.77■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 USP17L21D6R901 530 aa26.77■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 FOXP2O15409 715 aa26.77■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 C12orf60Q5U649 245 aa26.77■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 CTR9Q6PD62 1173 aa26.77■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 BRI3BPQ8WY22 251 aa26.77■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 FAM227BQ96M60 508 aa26.77■■□□□ 1.88
SYF2-201ENST00000236273 ATAD5Q96QE3 1844 aa26.76■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 A0A0D9SFI3 127 aa26.76■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 SHMT1P34896 483 aa26.76■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 SREBF2Q12772 1141 aa26.76■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.76■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 SKAP1Q86WV1 359 aa26.76■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 IFNL1Q8IU54 200 aa26.76■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 TSKSQ9UJT2 592 aa26.76■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa26.76■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 TRPA1O75762 1119 aa26.75■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 NEFLP07196 543 aa26.75■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 SDSP20132 328 aa26.75■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 GTF2A2P52657 109 aa26.75■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 MOGSQ13724 837 aa26.75■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.75■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 BEGAINQ9BUH8 593 aa26.75■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.75■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 SAGE1Q9NXZ1 904 aa26.75■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 ZHX2Q9Y6X8 837 aa26.75■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 CA12O43570 354 aa26.74■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 GNAT2P19087 354 aa26.74■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.74■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 PICK1Q9NRD5 415 aa26.74■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 GDF11O95390 407 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms