RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP10-5P60370 271 aa3.43□□□□□ -1.86
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.43□□□□□ -1.86
ZNF548-208ENST00000597576 PLAC4Q8WY50 150 aa3.43□□□□□ -1.86
ZNF548-208ENST00000597576 MT1BP07438 61 aa3.42□□□□□ -1.86
ZNF548-208ENST00000597576 SPRR2DP22532 72 aa3.42□□□□□ -1.86
ZNF548-208ENST00000597576 PRAC1Q96KF2 57 aa3.41□□□□□ -1.86
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.38□□□□□ -1.87
ZNF548-208ENST00000597576 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.38□□□□□ -1.87
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.36□□□□□ -1.87
ZNF548-208ENST00000597576 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.33□□□□□ -1.88
ZNF548-208ENST00000597576 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.33□□□□□ -1.88
ZNF548-208ENST00000597576 A0A0D9SG42 100 aa3.32□□□□□ -1.88
ZNF548-208ENST00000597576 ROMO1P60602 79 aa3.32□□□□□ -1.88
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.31□□□□□ -1.88
ZNF548-208ENST00000597576 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.3□□□□□ -1.88
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP12-1P59990 96 aa3.29□□□□□ -1.88
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP12-2P59991 146 aa3.27□□□□□ -1.89
ZNF548-208ENST00000597576 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.27□□□□□ -1.89
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.24□□□□□ -1.89
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.23□□□□□ -1.89
ZNF548-208ENST00000597576 MT1XP80297 61 aa3.21□□□□□ -1.9
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.14□□□□□ -1.91
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ZNF548-208ENST00000597576 TNP1P09430 55 aa3.1□□□□□ -1.91
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP10-12P60413 245 aa3.08□□□□□ -1.92
ZNF548-208ENST00000597576 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.08□□□□□ -1.92
ZNF548-208ENST00000597576 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.07□□□□□ -1.92
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ZNF548-208ENST00000597576 PP632Q6XCG6 107 aa3.05□□□□□ -1.92
ZNF548-208ENST00000597576 MT4P47944 62 aa3.04□□□□□ -1.92
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.03□□□□□ -1.92
ZNF548-208ENST00000597576 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.97□□□□□ -1.93
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFAF8A1L188 74 aa2.95□□□□□ -1.94
ZNF548-208ENST00000597576 LUZP6Q538Z0 58 aa2.91□□□□□ -1.94
ZNF548-208ENST00000597576 LCE3AQ5TA76 89 aa2.91□□□□□ -1.94
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.91□□□□□ -1.94
ZNF548-208ENST00000597576 MUC5ACP98088 5654 aa2.87□□□□□ -1.95
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.86□□□□□ -1.95
ZNF548-208ENST00000597576 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ZNF548-208ENST00000597576 A0A0A0MQY5 61 aa2.85□□□□□ -1.95
ZNF548-208ENST00000597576 MT1EP04732 61 aa2.85□□□□□ -1.95
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.85□□□□□ -1.95
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP12-3P60328 96 aa2.84□□□□□ -1.95
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.81□□□□□ -1.96
ZNF548-208ENST00000597576 MT1GP13640 62 aa2.79□□□□□ -1.96
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.75□□□□□ -1.97
ZNF548-208ENST00000597576 MT1LQ93083 61 aa2.75□□□□□ -1.97
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.71□□□□□ -1.98
ZNF548-208ENST00000597576 MT1MQ8N339 61 aa2.69□□□□□ -1.98
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP5-8O75690 187 aa2.64□□□□□ -1.99
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.64□□□□□ -1.99
ZNF548-208ENST00000597576 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.62□□□□□ -1.99
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.62□□□□□ -1.99
ZNF548-208ENST00000597576 INE1O15225 51 aa2.56□□□□□ -2
ZNF548-208ENST00000597576 LCE1EQ5T753 118 aa2.55□□□□□ -2
ZNF548-208ENST00000597576 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
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ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.5□□□□□ -2.01
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP12-4P60329 112 aa2.49□□□□□ -2.01
ZNF548-208ENST00000597576 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.45□□□□□ -2.02
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.39□□□□□ -2.03
ZNF548-208ENST00000597576 MT1AP04731 61 aa2.37□□□□□ -2.03
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.29□□□□□ -2.04
ZNF548-208ENST00000597576 MT3P25713 68 aa2.24□□□□□ -2.05
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.17□□□□□ -2.06
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ZNF548-208ENST00000597576 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.9□□□□□ -2.11
ZNF548-208ENST00000597576 PHGR1C9JFL3 82 aa1.89□□□□□ -2.11
ZNF548-208ENST00000597576 LCE1FQ5T754 118 aa1.86□□□□□ -2.11
ZNF548-208ENST00000597576 LCE1CQ5T751 118 aa1.82□□□□□ -2.12
ZNF548-208ENST00000597576 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.82□□□□□ -2.12
ZNF548-208ENST00000597576 PRM1P04553 51 aa1.7□□□□□ -2.14
ZNF548-208ENST00000597576 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.56□□□□□ -2.16
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.5□□□□□ -2.17
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.44□□□□□ -2.18
ZNF548-208ENST00000597576 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.99□□□□□ -2.25
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