RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496076.1

CLTC-208, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 2

Gene CLTC, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-208ENST00000496076 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-1.34□□□□□ -2.62
CLTC-208ENST00000496076 CFAP54Q96N23 3096 aa-1.34□□□□□ -2.62
CLTC-208ENST00000496076 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-1.36□□□□□ -2.63
CLTC-208ENST00000496076 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-1.37□□□□□ -2.63
CLTC-208ENST00000496076 SPEGQ15772 3267 aa-1.38□□□□□ -2.63
CLTC-208ENST00000496076 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-1.39□□□□□ -2.63
CLTC-208ENST00000496076 NFAT5O94916 1531 aa-1.4□□□□□ -2.63
CLTC-208ENST00000496076 VPS13CQ709C8 3753 aa-1.41□□□□□ -2.63
CLTC-208ENST00000496076 MT1FP04733 61 aa-1.41□□□□□ -2.64
CLTC-208ENST00000496076 LEAP2Q969E1 77 aa-1.41□□□□□ -2.64
CLTC-208ENST00000496076 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-1.43□□□□□ -2.64
CLTC-208ENST00000496076 CEP350Q5VT06 3117 aa-1.44□□□□□ -2.64
CLTC-208ENST00000496076 DEFB136Q30KP8 78 aa-1.45□□□□□ -2.64
CLTC-208ENST00000496076 CLTCL1P53675 1640 aa-1.45□□□□□ -2.64
CLTC-208ENST00000496076 TRPM2O94759 1503 aa-1.46□□□□□ -2.64
CLTC-208ENST00000496076 FRYLO94915 3013 aa-1.48□□□□□ -2.65
CLTC-208ENST00000496076 NDUFA1O15239 70 aa-1.5□□□□□ -2.65
CLTC-208ENST00000496076 PCNTO95613 3336 aa-1.51□□□□□ -2.65
CLTC-208ENST00000496076 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-1.57□□□□□ -2.66
CLTC-208ENST00000496076 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-1.6□□□□□ -2.67
CLTC-208ENST00000496076 SZT2Q5T011 3432 aa-1.61□□□□□ -2.67
CLTC-208ENST00000496076 MUC3AQ02505 3323 aa-1.62□□□□□ -2.67
CLTC-208ENST00000496076 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-1.62□□□□□ -2.67
CLTC-208ENST00000496076 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-1.63□□□□□ -2.67
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CLTC-208ENST00000496076 EP400Q96L91 3159 aa-1.65□□□□□ -2.67
CLTC-208ENST00000496076 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-1.66□□□□□ -2.68
CLTC-208ENST00000496076 USP34Q70CQ2 3546 aa-1.67□□□□□ -2.68
CLTC-208ENST00000496076 TTTY10Q9BZA0 68 aa-1.68□□□□□ -2.68
CLTC-208ENST00000496076 TOMM7Q9P0U1 55 aa-1.72□□□□□ -2.68
CLTC-208ENST00000496076 IQGAP2Q13576 1575 aa-1.78□□□□□ -2.69
CLTC-208ENST00000496076 TOMM5Q8N4H5 51 aa-1.79□□□□□ -2.7
CLTC-208ENST00000496076 UNC80Q8N2C7 3258 aa-1.79□□□□□ -2.7
CLTC-208ENST00000496076 LOC400499M0QZD8 3231 aa-1.81□□□□□ -2.7
CLTC-208ENST00000496076 CENPFP49454 3210 aa-1.81□□□□□ -2.7
CLTC-208ENST00000496076 VCANP13611 3396 aa-1.82□□□□□ -2.7
CLTC-208ENST00000496076 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-1.84□□□□□ -2.7
CLTC-208ENST00000496076 ASPMQ8IZT6 3477 aa-1.84□□□□□ -2.7
CLTC-208ENST00000496076 DEFB133Q30KQ1 61 aa-1.85□□□□□ -2.71
CLTC-208ENST00000496076 CD52P31358 61 aa-1.86□□□□□ -2.71
CLTC-208ENST00000496076 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-1.88□□□□□ -2.71
CLTC-208ENST00000496076 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-1.88□□□□□ -2.71
CLTC-208ENST00000496076 XIRP2A4UGR9 3374 aa-1.89□□□□□ -2.71
CLTC-208ENST00000496076 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-1.89□□□□□ -2.71
CLTC-208ENST00000496076 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-1.9□□□□□ -2.71
CLTC-208ENST00000496076 HTN1P15515 57 aa-1.93□□□□□ -2.72
CLTC-208ENST00000496076 ATP7AQ04656 1500 aa-1.95□□□□□ -2.72
CLTC-208ENST00000496076 CDH23Q9H251 3354 aa-1.95□□□□□ -2.72
CLTC-208ENST00000496076 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-1.95□□□□□ -2.72
CLTC-208ENST00000496076 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-1.99□□□□□ -2.73
CLTC-208ENST00000496076 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
CLTC-208ENST00000496076 BRCA2P51587 3418 aa-2□□□□□ -2.73
CLTC-208ENST00000496076 VPS13AQ96RL7 3174 aa-2.02□□□□□ -2.73
CLTC-208ENST00000496076 A0A096LNI7 61 aa-2.04□□□□□ -2.74
CLTC-208ENST00000496076 DEFB124Q8NES8 71 aa-2.09□□□□□ -2.74
CLTC-208ENST00000496076 MROH2BQ7Z745 1585 aa-2.14□□□□□ -2.75
CLTC-208ENST00000496076 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
CLTC-208ENST00000496076 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-2.16□□□□□ -2.76
CLTC-208ENST00000496076 LINC01556Q5JQF7 62 aa-2.18□□□□□ -2.76
CLTC-208ENST00000496076 UTRNP46939 3433 aa-2.18□□□□□ -2.76
CLTC-208ENST00000496076 H3BUX3 64 aa-2.3□□□□□ -2.78
CLTC-208ENST00000496076 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-2.41□□□□□ -2.8
CLTC-208ENST00000496076 APELAP0DMC3 54 aa-2.43□□□□□ -2.8
CLTC-208ENST00000496076 A0A096LPF7 62 aa-2.48□□□□□ -2.81
CLTC-208ENST00000496076 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-2.5□□□□□ -2.81
CLTC-208ENST00000496076 HTN3P15516 51 aa-2.51□□□□□ -2.81
CLTC-208ENST00000496076 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-2.53□□□□□ -2.82
CLTC-208ENST00000496076 K7EIM0 57 aa-2.54□□□□□ -2.82
CLTC-208ENST00000496076 PRCDQ00LT1 54 aa-2.55□□□□□ -2.82
CLTC-208ENST00000496076 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-2.58□□□□□ -2.82
CLTC-208ENST00000496076 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-2.6□□□□□ -2.83
CLTC-208ENST00000496076 Q9Y3F1 56 aa-2.62□□□□□ -2.83
CLTC-208ENST00000496076 H3BSH0 61 aa-2.71□□□□□ -2.84
CLTC-208ENST00000496076 COX14Q96I36 57 aa-2.8□□□□□ -2.86
CLTC-208ENST00000496076 RPL39P5Q59GN2 51 aa-2.88□□□□□ -2.87
CLTC-208ENST00000496076 DEFB108AA8MXU0 73 aa-2.9□□□□□ -2.87
CLTC-208ENST00000496076 DEFB108BQ8NET1 73 aa-3.02□□□□□ -2.89
CLTC-208ENST00000496076 STATHP02808 62 aa-3.16□□□□□ -2.92
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms