RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 C14orf144Q96I85 54 aa-1.85□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 SNHG12Q9BXW3 62 aa-1.85□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 TOMM7Q9P0U1 55 aa-1.85□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 A0A096LPF7 62 aa-1.86□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-1.86□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 CLTCL1P53675 1640 aa-1.88□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-1.88□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM11AP58511 58 aa-1.88□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 ABCA6Q8N139 1617 aa-1.88□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 A0A087WXM4 84 aa-1.89□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 NDUFA1O15239 70 aa-1.89□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 APELAP0DMC3 54 aa-1.9□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-1.9□□□□□ -2.71
ITGA4-211ENST00000490435 H0YGX0 51 aa-1.91□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 IQGAP1P46940 1657 aa-1.91□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-1.91□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-1.91□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 ABCC8Q09428 1581 aa-1.92□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-1.92□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 H3BUX3 64 aa-1.92□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 ATXN8Q156A1 80 aa-1.92□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 LINC01549A6NIU2 74 aa-1.93□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 NCMAPQ5T1S8 102 aa-1.93□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-1.93□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-1.93□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 ATP7AQ04656 1500 aa-1.94□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 H3BVH4 76 aa-1.94□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 PYY3Q5JQD4 70 aa-1.94□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 ST20Q9HBF5 79 aa-1.94□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 HTN3P15516 51 aa-1.95□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-1.95□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-1.95□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-1.95□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-1.96□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-1.97□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 SERF2P84101 59 aa-1.97□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 C18orf32Q8TCD1 76 aa-1.97□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 S100ZQ8WXG8 99 aa-1.97□□□□□ -2.72
ITGA4-211ENST00000490435 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-1.97□□□□□ -2.73
ITGA4-211ENST00000490435 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-1.97□□□□□ -2.73
ITGA4-211ENST00000490435 A0A087WWC5 75 aa-1.98□□□□□ -2.73
ITGA4-211ENST00000490435 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-1.98□□□□□ -2.73
ITGA4-211ENST00000490435 PLNP26678 52 aa-1.99□□□□□ -2.73
ITGA4-211ENST00000490435 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
ITGA4-211ENST00000490435 H3BSH0 61 aa-2□□□□□ -2.73
ITGA4-211ENST00000490435 PDCD5O14737 125 aa-2.01□□□□□ -2.73
ITGA4-211ENST00000490435 CPS1P31327 1500 aa-2.01□□□□□ -2.73
ITGA4-211ENST00000490435 PKIAP61925 76 aa-2.02□□□□□ -2.73
ITGA4-211ENST00000490435 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-2.02□□□□□ -2.73
ITGA4-211ENST00000490435 MROH2BQ7Z745 1585 aa-2.03□□□□□ -2.73
ITGA4-211ENST00000490435 K7EIM0 57 aa-2.05□□□□□ -2.74
ITGA4-211ENST00000490435 GNG13Q9P2W3 67 aa-2.05□□□□□ -2.74
ITGA4-211ENST00000490435 EFCAB5A4FU69 1503 aa-2.06□□□□□ -2.74
ITGA4-211ENST00000490435 ADIRFQ15847 76 aa-2.06□□□□□ -2.74
ITGA4-211ENST00000490435 PRCDQ00LT1 54 aa-2.07□□□□□ -2.74
ITGA4-211ENST00000490435 M0R143 59 aa-2.08□□□□□ -2.74
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB108BQ8NET1 73 aa-2.09□□□□□ -2.74
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-2.09□□□□□ -2.74
ITGA4-211ENST00000490435 IQGAP2Q13576 1575 aa-2.1□□□□□ -2.75
ITGA4-211ENST00000490435 Q9H521 79 aa-2.12□□□□□ -2.75
ITGA4-211ENST00000490435 CMC2Q9NRP2 79 aa-2.12□□□□□ -2.75
ITGA4-211ENST00000490435 S100A13Q99584 98 aa-2.13□□□□□ -2.75
ITGA4-211ENST00000490435 Q9Y3F1 56 aa-2.13□□□□□ -2.75
ITGA4-211ENST00000490435 V9GYS6 101 aa-2.13□□□□□ -2.75
ITGA4-211ENST00000490435 COX14Q96I36 57 aa-2.14□□□□□ -2.75
ITGA4-211ENST00000490435 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-2.15□□□□□ -2.75
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB108AA8MXU0 73 aa-2.16□□□□□ -2.76
ITGA4-211ENST00000490435 STATHP02808 62 aa-2.16□□□□□ -2.76
ITGA4-211ENST00000490435 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-2.16□□□□□ -2.76
ITGA4-211ENST00000490435 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-2.2□□□□□ -2.76
ITGA4-211ENST00000490435 RPL39P5Q59GN2 51 aa-2.21□□□□□ -2.76
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM5Q71RC9 77 aa-2.3□□□□□ -2.78
ITGA4-211ENST00000490435 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-2.31□□□□□ -2.78
ITGA4-211ENST00000490435 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-2.31□□□□□ -2.78
ITGA4-211ENST00000490435 GNG2P59768 71 aa-2.35□□□□□ -2.79
ITGA4-211ENST00000490435 TOMM5Q8N4H5 51 aa-2.45□□□□□ -2.8
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-2.5□□□□□ -2.81
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms