RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-2.27□□□□□ -2.77
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PTEN-204ENST00000487939 AGLP35573 1532 aa-2.27□□□□□ -2.77
PTEN-204ENST00000487939 CLTCL1P53675 1640 aa-2.29□□□□□ -2.78
PTEN-204ENST00000487939 IGIPA6NJ69 53 aa-2.31□□□□□ -2.78
PTEN-204ENST00000487939 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-2.32□□□□□ -2.78
PTEN-204ENST00000487939 S100ZQ8WXG8 99 aa-2.32□□□□□ -2.78
PTEN-204ENST00000487939 TTTY10Q9BZA0 68 aa-2.32□□□□□ -2.78
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PTEN-204ENST00000487939 LOC400499M0QZD8 3231 aa-2.37□□□□□ -2.79
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PTEN-204ENST00000487939 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-2.42□□□□□ -2.8
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PTEN-204ENST00000487939 APELAP0DMC3 54 aa-3.19□□□□□ -2.92
PTEN-204ENST00000487939 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-3.2□□□□□ -2.92
PTEN-204ENST00000487939 A0A096LPF7 62 aa-3.22□□□□□ -2.92
PTEN-204ENST00000487939 K7EIM0 57 aa-3.22□□□□□ -2.92
PTEN-204ENST00000487939 TOMM5Q8N4H5 51 aa-3.28□□□□□ -2.93
PTEN-204ENST00000487939 PRCDQ00LT1 54 aa-3.3□□□□□ -2.94
PTEN-204ENST00000487939 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-3.32□□□□□ -2.94
PTEN-204ENST00000487939 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-3.33□□□□□ -2.94
PTEN-204ENST00000487939 HTN3P15516 51 aa-3.36□□□□□ -2.95
PTEN-204ENST00000487939 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-3.36□□□□□ -2.95
PTEN-204ENST00000487939 Q9Y3F1 56 aa-3.51□□□□□ -2.97
PTEN-204ENST00000487939 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-3.6□□□□□ -2.99
PTEN-204ENST00000487939 RPL39P5Q59GN2 51 aa-3.63□□□□□ -2.99
PTEN-204ENST00000487939 H3BSH0 61 aa-3.64□□□□□ -2.99
PTEN-204ENST00000487939 DEFB108AA8MXU0 73 aa-3.7□□□□□ -3
PTEN-204ENST00000487939 COX14Q96I36 57 aa-3.74□□□□□ -3.01
PTEN-204ENST00000487939 DEFB108BQ8NET1 73 aa-3.93□□□□□ -3.04
PTEN-204ENST00000487939 STATHP02808 62 aa-4.25□□□□□ -3.09
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