RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-1.87□□□□□ -2.71
SENP6-210ENST00000487548 AGLP35573 1532 aa-1.87□□□□□ -2.71
SENP6-210ENST00000487548 LINC00587B1AMM8 73 aa-1.89□□□□□ -2.71
SENP6-210ENST00000487548 C14orf144Q96I85 54 aa-1.89□□□□□ -2.71
SENP6-210ENST00000487548 TOMM7Q9P0U1 55 aa-1.89□□□□□ -2.71
SENP6-210ENST00000487548 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-1.89□□□□□ -2.71
SENP6-210ENST00000487548 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-1.9□□□□□ -2.71
SENP6-210ENST00000487548 LINC01549A6NIU2 74 aa-1.9□□□□□ -2.71
SENP6-210ENST00000487548 PDCD5O14737 125 aa-1.9□□□□□ -2.71
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SENP6-210ENST00000487548 DEFB124Q8NES8 71 aa-1.9□□□□□ -2.71
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SENP6-210ENST00000487548 TDRG1Q3Y452 100 aa-1.92□□□□□ -2.72
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SENP6-210ENST00000487548 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-1.92□□□□□ -2.72
SENP6-210ENST00000487548 NFAT5O94916 1531 aa-1.92□□□□□ -2.72
SENP6-210ENST00000487548 C18orf32Q8TCD1 76 aa-1.93□□□□□ -2.72
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SENP6-210ENST00000487548 ADCY10Q96PN6 1610 aa-1.99□□□□□ -2.73
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SENP6-210ENST00000487548 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-2.09□□□□□ -2.74
SENP6-210ENST00000487548 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-2.1□□□□□ -2.75
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SENP6-210ENST00000487548 IQGAP1P46940 1657 aa-2.11□□□□□ -2.75
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SENP6-210ENST00000487548 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-2.12□□□□□ -2.75
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SENP6-210ENST00000487548 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-2.16□□□□□ -2.76
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SENP6-210ENST00000487548 APELAP0DMC3 54 aa-2.17□□□□□ -2.76
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SENP6-210ENST00000487548 K7EIM0 57 aa-2.35□□□□□ -2.79
SENP6-210ENST00000487548 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-2.35□□□□□ -2.79
SENP6-210ENST00000487548 Q9Y3F1 56 aa-2.38□□□□□ -2.79
SENP6-210ENST00000487548 H3BSH0 61 aa-2.39□□□□□ -2.79
SENP6-210ENST00000487548 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-2.39□□□□□ -2.79
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SENP6-210ENST00000487548 IQGAP2Q13576 1575 aa-2.49□□□□□ -2.81
SENP6-210ENST00000487548 COX14Q96I36 57 aa-2.5□□□□□ -2.81
SENP6-210ENST00000487548 TOMM5Q8N4H5 51 aa-2.57□□□□□ -2.82
SENP6-210ENST00000487548 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
SENP6-210ENST00000487548 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-2.6□□□□□ -2.83
SENP6-210ENST00000487548 RPL39P5Q59GN2 51 aa-2.61□□□□□ -2.83
SENP6-210ENST00000487548 DEFB108AA8MXU0 73 aa-2.63□□□□□ -2.83
SENP6-210ENST00000487548 DEFB108BQ8NET1 73 aa-2.67□□□□□ -2.84
SENP6-210ENST00000487548 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-2.69□□□□□ -2.84
SENP6-210ENST00000487548 STATHP02808 62 aa-2.75□□□□□ -2.85
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