RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 PFDN5Q99471 154 aa-2.12□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMIM3Q9BZL3 60 aa-2.12□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 DPY30Q9C005 99 aa-2.12□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1B0GWA3 101 aa-2.13□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 CATR1Q13166 79 aa-2.13□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 K7EMI3 77 aa-2.14□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC167Q9P0B6 97 aa-2.14□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 H0YGX0 51 aa-2.15□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 K7ERU9 68 aa-2.15□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 COPS9Q8WXC6 57 aa-2.16□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa-2.17□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-2.17□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLNP26678 52 aa-2.17□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARPC4P59998 168 aa-2.17□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTDAPP60985 99 aa-2.17□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-2.17□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1B0GUT8 65 aa-2.18□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 UQCR10Q9UDW1 63 aa-2.18□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-2.19□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-2.19□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-2.2□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 SERF2P84101 59 aa-2.21□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 S100A13Q99584 98 aa-2.21□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC01549A6NIU2 74 aa-2.22□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-2.22□□□□□ -2.76
CACNA2D1-211ENST00000486539 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-2.23□□□□□ -2.77
CACNA2D1-211ENST00000486539 VAMP8Q9BV40 100 aa-2.24□□□□□ -2.77
CACNA2D1-211ENST00000486539 PEA15Q15121 130 aa-2.25□□□□□ -2.77
CACNA2D1-211ENST00000486539 COX6CP09669 75 aa-2.26□□□□□ -2.77
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-2.26□□□□□ -2.77
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-2.26□□□□□ -2.77
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP3R1P63098 170 aa-2.27□□□□□ -2.77
CACNA2D1-211ENST00000486539 DR1Q01658 176 aa-2.28□□□□□ -2.77
CACNA2D1-211ENST00000486539 LZICQ8WZA0 190 aa-2.28□□□□□ -2.77
CACNA2D1-211ENST00000486539 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-2.28□□□□□ -2.77
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRO1854Q9UHT4 67 aa-2.3□□□□□ -2.78
CACNA2D1-211ENST00000486539 APOC2P02655 101 aa-2.31□□□□□ -2.78
CACNA2D1-211ENST00000486539 ETDBQ3ZM63 59 aa-2.31□□□□□ -2.78
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-2.31□□□□□ -2.78
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNG4P50150 75 aa-2.32□□□□□ -2.78
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATXN8Q156A1 80 aa-2.32□□□□□ -2.78
CACNA2D1-211ENST00000486539 PMCHL1Q16048 86 aa-2.32□□□□□ -2.78
CACNA2D1-211ENST00000486539 CMC2Q9NRP2 79 aa-2.32□□□□□ -2.78
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNG8Q9UK08 70 aa-2.32□□□□□ -2.78
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-2.33□□□□□ -2.78
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNG2P59768 71 aa-2.34□□□□□ -2.78
CACNA2D1-211ENST00000486539 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-2.34□□□□□ -2.78
CACNA2D1-211ENST00000486539 MANBALQ9NQG1 85 aa-2.34□□□□□ -2.78
CACNA2D1-211ENST00000486539 HMGN1P05114 100 aa-2.35□□□□□ -2.79
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNG11P61952 73 aa-2.35□□□□□ -2.79
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-2.36□□□□□ -2.79
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-2.36□□□□□ -2.79
CACNA2D1-211ENST00000486539 S100A1P23297 94 aa-2.37□□□□□ -2.79
CACNA2D1-211ENST00000486539 C18orf32Q8TCD1 76 aa-2.43□□□□□ -2.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 EFCAB10A6NFE3 127 aa-2.44□□□□□ -2.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM25AB3EWG3 89 aa-2.45□□□□□ -2.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM25CB3EWG5 89 aa-2.45□□□□□ -2.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM25GB3EWG6 89 aa-2.45□□□□□ -2.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMIM11AP58511 58 aa-2.45□□□□□ -2.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00643Q86TS7 51 aa-2.45□□□□□ -2.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNG13Q9P2W3 67 aa-2.46□□□□□ -2.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 DLEU1O43261 78 aa-2.47□□□□□ -2.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKAIN1P0CW23 69 aa-2.5□□□□□ -2.81
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADIRFQ15847 76 aa-2.51□□□□□ -2.81
CACNA2D1-211ENST00000486539 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-2.55□□□□□ -2.82
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAUP35544 74 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
CACNA2D1-211ENST00000486539 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-2.57□□□□□ -2.82
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNGT2O14610 69 aa-2.57□□□□□ -2.82
CACNA2D1-211ENST00000486539 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-2.58□□□□□ -2.82
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-2.58□□□□□ -2.82
CACNA2D1-211ENST00000486539 SVBPQ8N300 66 aa-2.58□□□□□ -2.82
CACNA2D1-211ENST00000486539 C14orf144Q96I85 54 aa-2.59□□□□□ -2.82
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOMM5Q8N4H5 51 aa-2.66□□□□□ -2.84
CACNA2D1-211ENST00000486539 PYY3Q5JQD4 70 aa-2.68□□□□□ -2.84
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q9H521 79 aa-2.7□□□□□ -2.84
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0R143 59 aa-2.71□□□□□ -2.84
CACNA2D1-211ENST00000486539 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-2.78□□□□□ -2.85
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1B0GV90 55 aa-2.83□□□□□ -2.86
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms