RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 CRIP1P50238 77 aa1.71□□□□□ -2.13
RABGGTB-204ENST00000461653 ANGP03950 147 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
RABGGTB-204ENST00000461653 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa1.69□□□□□ -2.14
RABGGTB-204ENST00000461653 Q8IZM0 81 aa1.68□□□□□ -2.14
RABGGTB-204ENST00000461653 MT1HP80294 61 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-204ENST00000461653 COX6A2Q02221 97 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-204ENST00000461653 KMT2DO14686 5537 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-204ENST00000461653 C10orf95Q9H7T3 257 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-204ENST00000461653 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-204ENST00000461653 CRIPTQ9P021 101 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A096LNI7 61 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-204ENST00000461653 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-204ENST00000461653 RPL39P62891 51 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-204ENST00000461653 CLPSL2Q6UWE3 100 aa1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-204ENST00000461653 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.6□□□□□ -2.15
RABGGTB-204ENST00000461653 M0R2T5 61 aa1.6□□□□□ -2.15
RABGGTB-204ENST00000461653 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
RABGGTB-204ENST00000461653 C6orf48Q9UBA6 75 aa1.59□□□□□ -2.16
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A0D9SG42 100 aa1.58□□□□□ -2.16
RABGGTB-204ENST00000461653 K7EQZ3 153 aa1.58□□□□□ -2.16
RABGGTB-204ENST00000461653 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP1.58□□□□□ -2.16
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-204ENST00000461653 COX6B2Q6YFQ2 88 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-204ENST00000461653 WFDC13Q8IUB5 93 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-204ENST00000461653 H0YAA0 97 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-204ENST00000461653 MDN1Q9NU22 5596 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-204ENST00000461653 M0QY20 66 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-204ENST00000461653 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-204ENST00000461653 MT2AP02795 61 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-204ENST00000461653 MT1FP04733 61 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-204ENST00000461653 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-204ENST00000461653 TOMM7Q9P0U1 55 aa1.48□□□□□ -2.17
RABGGTB-204ENST00000461653 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-204ENST00000461653 SPINK1P00995 79 aa1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-204ENST00000461653 C9orf92A6NGG3 77 aa1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-204ENST00000461653 DEFB105AQ8NG35 78 aa1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-204ENST00000461653 MUC5ACP98088 5654 aa1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-204ENST00000461653 SPRR1AP35321 89 aa1.43□□□□□ -2.18
RABGGTB-204ENST00000461653 PRLHP81277 87 aa1.42□□□□□ -2.18
RABGGTB-204ENST00000461653 RPS29P62273 56 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-204ENST00000461653 SPRR2EP22531 72 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-204ENST00000461653 SPRR2BP35325 72 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-204ENST00000461653 SPRR2AP35326 72 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-204ENST00000461653 SPRR1BP22528 89 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-204ENST00000461653 SPRR2DP22532 72 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-204ENST00000461653 S4R3F8 94 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-204ENST00000461653 SPRR2FQ96RM1 72 aa1.34□□□□□ -2.2
RABGGTB-204ENST00000461653 MT1BP07438 61 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-204ENST00000461653 MT4P47944 62 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-204ENST00000461653 M0QZ58 72 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-204ENST00000461653 SPRR2GQ9BYE4 73 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-204ENST00000461653 MT1XP80297 61 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-204ENST00000461653 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.08□□□□□ -2.24
RABGGTB-204ENST00000461653 TNP1P09430 55 aa1.08□□□□□ -2.24
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-204ENST00000461653 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-204ENST00000461653 MT1EP04732 61 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-204ENST00000461653 MT1GP13640 62 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-204ENST00000461653 MT1MQ8N339 61 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-204ENST00000461653 MT1LQ93083 61 aa0.95□□□□□ -2.26
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.94□□□□□ -2.26
RABGGTB-204ENST00000461653 PRM1P04553 51 aa0.89□□□□□ -2.27
RABGGTB-204ENST00000461653 PHGR1C9JFL3 82 aa0.86□□□□□ -2.27
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.82□□□□□ -2.28
RABGGTB-204ENST00000461653 MT1AP04731 61 aa0.79□□□□□ -2.28
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.75□□□□□ -2.29
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