RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637533.1

MECP2-222, Transcript of methyl-CpG binding protein 2, human

TSL 5

Gene MECP2, Length 140 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MECP2-222	ENST00000637533	FRY	Q5TBA9	3013 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MECP2-222	ENST00000637533	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MECP2-222	ENST00000637533	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MECP2-222	ENST00000637533	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
MECP2-222	ENST00000637533	PHGR1	C9JFL3	82 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	STAB1	Q9NY15	2570 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	LAMA1	P25391	3075 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	MT1E	P04732	61 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	ITPR3	Q14573	2671 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	AKAP9	Q99996	3911 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	LYST	Q99698	3801 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	KALRN	O60229	2985 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	HSPG2	P98160	4391 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	COL12A1	Q99715	3063 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	HTN1	P15515	57 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	SSPO	A2VEC9	5147 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	TRIO	O75962	3097 aa		0.12	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	MT1L	Q93083	61 aa		0.11	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		0.1	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		0.09	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	LRP2	P98164	4655 aa		0.09	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		0.09	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		0.09	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	0.09	□□□□□ -2.39
MECP2-222	ENST00000637533	MT1HL1	P0DM35	61 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		0.09	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		0.08	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	MT1X	P80297	61 aa		0.08	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	LRBA	P50851	2863 aa		0.08	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	DNAH2	Q9P225	4427 aa		0.08	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		0.08	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		0.07	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	ITPR2	Q14571	2701 aa		0.07	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		0.07	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		0.07	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		0.07	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		0.07	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	MDN1	Q9NU22	5596 aa		0.06	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		0.06	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533		A0A096LNI7	61 aa		0.06	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		0.06	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		0.06	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	LAMA5	O15230	3695 aa		0.06	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		0.05	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		0.05	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		0.05	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	CUBN	O60494	3623 aa		0.05	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	CEP250	Q9BV73	2442 aa		0.05	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		0.05	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		0.05	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	LAMA3	Q16787	3333 aa		0.04	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		0.04	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		0.04	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		0.03	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		0.03	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		0.03	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533		H3BSH0	61 aa		0.03	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	DEFB4A	O15263	64 aa		0.03	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	COX14	Q96I36	57 aa		0.03	□□□□□ -2.4
MECP2-222	ENST00000637533	MGA	Q8IWI9	3026 aa		0.03	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		0.03	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		0.02	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		0.02	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		0.02	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	C5orf42	Q9H799	3197 aa		0.02	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		0.02	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	MT2A	P02795	61 aa		0.01	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	MT1M	Q8N339	61 aa		0.01	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		0.01	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	-0	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	FRYL	O94915	3013 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	MT1G	P13640	62 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	MT4	P47944	62 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	ATM	Q13315	3056 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	CFAP54	Q96N23	3096 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
MECP2-222	ENST00000637533	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		-0.02	□□□□□ -2.41

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