RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631040.2

NRG1-222, Transcript of neuregulin 1, human

TSL 5

Gene NRG1, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRG1-222	ENST00000631040	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		0.9	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040		S4R3F8	94 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	AKAP6	Q13023	2319 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		0.89	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	SPTA1	P02549	2419 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	ZAN	Q9Y493	2812 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	HTN1	P15515	57 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	PRLH	P81277	87 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	PRO0255	Q9UI72	69 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	TRIO	O75962	3097 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		0.88	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	HIVEP1	P15822	2718 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	LAMA1	P25391	3075 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	CREBBP	Q92793	2442 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040		Q5VSD8	79 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	SPTBN2	O15020	2390 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	APC	P25054	2843 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		0.87	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	ATM	Q13315	3056 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	APC2	O95996	2303 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	LAMA5	O15230	3695 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	APLN	Q9ULZ1	77 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	BSN	Q9UPA5	3926 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	ANK2	Q01484	3957 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	RYR3	Q15413	4870 aa		0.86	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	TENM3	Q9P273	2699 aa		0.85	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	SPINK1	P00995	79 aa		0.85	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		0.84	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	MUC2	Q02817	5179 aa		0.84	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
NRG1-222	ENST00000631040	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		0.84	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	CACNA1H	O95180	2353 aa		0.83	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040		M0QZ58	72 aa		0.83	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	DEFB136	Q30KP8	78 aa		0.83	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		0.83	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		0.82	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		0.82	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		0.82	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	VPS13C	Q709C8	3753 aa		0.82	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040		H3BNG1	76 aa		0.82	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040		U3KQA8	63 aa		0.82	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		0.82	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		0.82	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	TACC2	O95359	2948 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	DEFB124	Q8NES8	71 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040		A0A096LPF7	62 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	HSPG2	P98160	4391 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	CUBN	O60494	3623 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	LYST	Q99698	3801 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	FAM186A	A6NE01	2351 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040		A0A096LNI7	61 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NRG1-222	ENST00000631040	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NRG1-222	ENST00000631040	F8	P00451	2351 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NRG1-222	ENST00000631040	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NRG1-222	ENST00000631040	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NRG1-222	ENST00000631040	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NRG1-222	ENST00000631040	HERC1	Q15751	4861 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NRG1-222	ENST00000631040	PKD1	P98161	4303 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NRG1-222	ENST00000631040	COL7A1	Q02388	2944 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NRG1-222	ENST00000631040	TNXB	P22105	4242 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NRG1-222	ENST00000631040	NBAS	A2RRP1	2371 aa		0.76	□□□□□ -2.29
NRG1-222	ENST00000631040	NEB	P20929	6669 aa		0.75	□□□□□ -2.29

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